Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4J9

4931423N10Rik, MCG52616, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4931423N10RikQ9D4J9 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
4931423N10RikQ9D4J9 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
4931423N10RikQ9D4J9 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
4931423N10RikQ9D4J9 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
4931423N10RikQ9D4J9 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
4931423N10RikQ9D4J9 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
4931423N10RikQ9D4J9 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
4931423N10RikQ9D4J9 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
4931423N10RikQ9D4J9 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
4931423N10RikQ9D4J9 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
4931423N10RikQ9D4J9 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
4931423N10RikQ9D4J9 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
4931423N10RikQ9D4J9 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
4931423N10RikQ9D4J9 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
4931423N10RikQ9D4J9 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
4931423N10RikQ9D4J9 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
4931423N10RikQ9D4J9 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
4931423N10RikQ9D4J9 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
4931423N10RikQ9D4J9 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
4931423N10RikQ9D4J9 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
4931423N10RikQ9D4J9 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
4931423N10RikQ9D4J9 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
4931423N10RikQ9D4J9 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
4931423N10RikQ9D4J9 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
4931423N10RikQ9D4J9 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
4931423N10RikQ9D4J9 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
4931423N10RikQ9D4J9 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
4931423N10RikQ9D4J9 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
4931423N10RikQ9D4J9 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
4931423N10RikQ9D4J9 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
4931423N10RikQ9D4J9 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
4931423N10RikQ9D4J9 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
4931423N10RikQ9D4J9 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
4931423N10RikQ9D4J9 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
4931423N10RikQ9D4J9 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
4931423N10RikQ9D4J9 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
4931423N10RikQ9D4J9 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
4931423N10RikQ9D4J9 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
4931423N10RikQ9D4J9 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
4931423N10RikQ9D4J9 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
4931423N10RikQ9D4J9 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
4931423N10RikQ9D4J9 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
4931423N10RikQ9D4J9 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
4931423N10RikQ9D4J9 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
4931423N10RikQ9D4J9 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
4931423N10RikQ9D4J9 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
4931423N10RikQ9D4J9 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
4931423N10RikQ9D4J9 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
4931423N10RikQ9D4J9 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
4931423N10RikQ9D4J9 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
4931423N10RikQ9D4J9 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
4931423N10RikQ9D4J9 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
4931423N10RikQ9D4J9 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
4931423N10RikQ9D4J9 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
4931423N10RikQ9D4J9 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
4931423N10RikQ9D4J9 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
4931423N10RikQ9D4J9 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
4931423N10RikQ9D4J9 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
4931423N10RikQ9D4J9 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
4931423N10RikQ9D4J9 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
4931423N10RikQ9D4J9 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
4931423N10RikQ9D4J9 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
4931423N10RikQ9D4J9 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
4931423N10RikQ9D4J9 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
4931423N10RikQ9D4J9 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
4931423N10RikQ9D4J9 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
4931423N10RikQ9D4J9 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
4931423N10RikQ9D4J9 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
4931423N10RikQ9D4J9 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
4931423N10RikQ9D4J9 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
4931423N10RikQ9D4J9 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
4931423N10RikQ9D4J9 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
4931423N10RikQ9D4J9 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
4931423N10RikQ9D4J9 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
4931423N10RikQ9D4J9 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
4931423N10RikQ9D4J9 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
4931423N10RikQ9D4J9 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
4931423N10RikQ9D4J9 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
4931423N10RikQ9D4J9 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
4931423N10RikQ9D4J9 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
4931423N10RikQ9D4J9 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
4931423N10RikQ9D4J9 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
4931423N10RikQ9D4J9 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
4931423N10RikQ9D4J9 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
4931423N10RikQ9D4J9 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
4931423N10RikQ9D4J9 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
4931423N10RikQ9D4J9 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
4931423N10RikQ9D4J9 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
4931423N10RikQ9D4J9 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
4931423N10RikQ9D4J9 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
4931423N10RikQ9D4J9 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
4931423N10RikQ9D4J9 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
4931423N10RikQ9D4J9 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
4931423N10RikQ9D4J9 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
4931423N10RikQ9D4J9 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
4931423N10RikQ9D4J9 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
4931423N10RikQ9D4J9 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
4931423N10RikQ9D4J9 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
4931423N10RikQ9D4J9 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
4931423N10RikQ9D4J9 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms