Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H7

Lonrf3, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lonrf3Q9D4H7 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Lonrf3Q9D4H7 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Lonrf3Q9D4H7 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Lonrf3Q9D4H7 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Lonrf3Q9D4H7 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Lonrf3Q9D4H7 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Lonrf3Q9D4H7 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Lonrf3Q9D4H7 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Lonrf3Q9D4H7 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Lonrf3Q9D4H7 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Lonrf3Q9D4H7 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Lonrf3Q9D4H7 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Lonrf3Q9D4H7 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Lonrf3Q9D4H7 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Lonrf3Q9D4H7 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Lonrf3Q9D4H7 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Lonrf3Q9D4H7 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Lonrf3Q9D4H7 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Lonrf3Q9D4H7 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Lonrf3Q9D4H7 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Lonrf3Q9D4H7 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Lonrf3Q9D4H7 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Lonrf3Q9D4H7 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Lonrf3Q9D4H7 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Lonrf3Q9D4H7 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Lonrf3Q9D4H7 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Lonrf3Q9D4H7 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Lonrf3Q9D4H7 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Lonrf3Q9D4H7 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Lonrf3Q9D4H7 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Lonrf3Q9D4H7 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Lonrf3Q9D4H7 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Lonrf3Q9D4H7 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Lonrf3Q9D4H7 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Lonrf3Q9D4H7 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Lonrf3Q9D4H7 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Lonrf3Q9D4H7 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Lonrf3Q9D4H7 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Lonrf3Q9D4H7 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Lonrf3Q9D4H7 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Lonrf3Q9D4H7 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Lonrf3Q9D4H7 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Lonrf3Q9D4H7 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Lonrf3Q9D4H7 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Lonrf3Q9D4H7 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Lonrf3Q9D4H7 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Lonrf3Q9D4H7 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Lonrf3Q9D4H7 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Lonrf3Q9D4H7 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Lonrf3Q9D4H7 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Lonrf3Q9D4H7 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Lonrf3Q9D4H7 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Lonrf3Q9D4H7 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Lonrf3Q9D4H7 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Lonrf3Q9D4H7 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Lonrf3Q9D4H7 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Lonrf3Q9D4H7 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Lonrf3Q9D4H7 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Lonrf3Q9D4H7 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Lonrf3Q9D4H7 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Lonrf3Q9D4H7 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Lonrf3Q9D4H7 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Lonrf3Q9D4H7 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Lonrf3Q9D4H7 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Lonrf3Q9D4H7 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Lonrf3Q9D4H7 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Lonrf3Q9D4H7 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Lonrf3Q9D4H7 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Lonrf3Q9D4H7 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Lonrf3Q9D4H7 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lonrf3Q9D4H7 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lonrf3Q9D4H7 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lonrf3Q9D4H7 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lonrf3Q9D4H7 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lonrf3Q9D4H7 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lonrf3Q9D4H7 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lonrf3Q9D4H7 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lonrf3Q9D4H7 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lonrf3Q9D4H7 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lonrf3Q9D4H7 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lonrf3Q9D4H7 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lonrf3Q9D4H7 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lonrf3Q9D4H7 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lonrf3Q9D4H7 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lonrf3Q9D4H7 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lonrf3Q9D4H7 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Lonrf3Q9D4H7 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Lonrf3Q9D4H7 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lonrf3Q9D4H7 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lonrf3Q9D4H7 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lonrf3Q9D4H7 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lonrf3Q9D4H7 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lonrf3Q9D4H7 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lonrf3Q9D4H7 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lonrf3Q9D4H7 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Lonrf3Q9D4H7 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Lonrf3Q9D4H7 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Lonrf3Q9D4H7 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Lonrf3Q9D4H7 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Lonrf3Q9D4H7 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms