Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4D3

4933402D24Rik, MCG113882, mousemouse

Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933402D24RikQ9D4D3 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4933402D24RikQ9D4D3 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
4933402D24RikQ9D4D3 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4933402D24RikQ9D4D3 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
4933402D24RikQ9D4D3 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
4933402D24RikQ9D4D3 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4933402D24RikQ9D4D3 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4933402D24RikQ9D4D3 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4933402D24RikQ9D4D3 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4933402D24RikQ9D4D3 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
4933402D24RikQ9D4D3 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4933402D24RikQ9D4D3 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4933402D24RikQ9D4D3 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
4933402D24RikQ9D4D3 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
4933402D24RikQ9D4D3 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
4933402D24RikQ9D4D3 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4933402D24RikQ9D4D3 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4933402D24RikQ9D4D3 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4933402D24RikQ9D4D3 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4933402D24RikQ9D4D3 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4933402D24RikQ9D4D3 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4933402D24RikQ9D4D3 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4933402D24RikQ9D4D3 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4933402D24RikQ9D4D3 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4933402D24RikQ9D4D3 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
4933402D24RikQ9D4D3 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4933402D24RikQ9D4D3 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4933402D24RikQ9D4D3 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4933402D24RikQ9D4D3 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4933402D24RikQ9D4D3 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4933402D24RikQ9D4D3 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
4933402D24RikQ9D4D3 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4933402D24RikQ9D4D3 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4933402D24RikQ9D4D3 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4933402D24RikQ9D4D3 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
4933402D24RikQ9D4D3 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4933402D24RikQ9D4D3 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4933402D24RikQ9D4D3 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4933402D24RikQ9D4D3 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
4933402D24RikQ9D4D3 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
4933402D24RikQ9D4D3 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4933402D24RikQ9D4D3 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
4933402D24RikQ9D4D3 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
4933402D24RikQ9D4D3 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4933402D24RikQ9D4D3 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
4933402D24RikQ9D4D3 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
4933402D24RikQ9D4D3 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4933402D24RikQ9D4D3 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
4933402D24RikQ9D4D3 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
4933402D24RikQ9D4D3 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4933402D24RikQ9D4D3 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4933402D24RikQ9D4D3 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
4933402D24RikQ9D4D3 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4933402D24RikQ9D4D3 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4933402D24RikQ9D4D3 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
4933402D24RikQ9D4D3 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4933402D24RikQ9D4D3 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4933402D24RikQ9D4D3 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4933402D24RikQ9D4D3 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4933402D24RikQ9D4D3 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
4933402D24RikQ9D4D3 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4933402D24RikQ9D4D3 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
4933402D24RikQ9D4D3 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4933402D24RikQ9D4D3 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
4933402D24RikQ9D4D3 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
4933402D24RikQ9D4D3 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4933402D24RikQ9D4D3 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4933402D24RikQ9D4D3 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4933402D24RikQ9D4D3 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4933402D24RikQ9D4D3 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4933402D24RikQ9D4D3 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4933402D24RikQ9D4D3 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4933402D24RikQ9D4D3 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4933402D24RikQ9D4D3 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4933402D24RikQ9D4D3 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4933402D24RikQ9D4D3 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
4933402D24RikQ9D4D3 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4933402D24RikQ9D4D3 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4933402D24RikQ9D4D3 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4933402D24RikQ9D4D3 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4933402D24RikQ9D4D3 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4933402D24RikQ9D4D3 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4933402D24RikQ9D4D3 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4933402D24RikQ9D4D3 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
4933402D24RikQ9D4D3 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4933402D24RikQ9D4D3 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
4933402D24RikQ9D4D3 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
4933402D24RikQ9D4D3 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4933402D24RikQ9D4D3 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
4933402D24RikQ9D4D3 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
4933402D24RikQ9D4D3 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
4933402D24RikQ9D4D3 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
4933402D24RikQ9D4D3 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4933402D24RikQ9D4D3 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4933402D24RikQ9D4D3 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4933402D24RikQ9D4D3 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4933402D24RikQ9D4D3 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4933402D24RikQ9D4D3 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4933402D24RikQ9D4D3 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4933402D24RikQ9D4D3 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms