Protein–RNA interactions for Protein: Q9D495

Syce1, Synaptonemal complex central element protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce1Q9D495 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Syce1Q9D495 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Syce1Q9D495 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Syce1Q9D495 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Syce1Q9D495 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Syce1Q9D495 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Syce1Q9D495 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Syce1Q9D495 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Syce1Q9D495 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Syce1Q9D495 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Syce1Q9D495 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Syce1Q9D495 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Syce1Q9D495 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Syce1Q9D495 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Syce1Q9D495 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Syce1Q9D495 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Syce1Q9D495 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Syce1Q9D495 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Syce1Q9D495 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Syce1Q9D495 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Syce1Q9D495 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Syce1Q9D495 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Syce1Q9D495 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Syce1Q9D495 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Syce1Q9D495 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Syce1Q9D495 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Syce1Q9D495 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Syce1Q9D495 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Syce1Q9D495 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Syce1Q9D495 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Syce1Q9D495 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Syce1Q9D495 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Syce1Q9D495 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Syce1Q9D495 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Syce1Q9D495 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Syce1Q9D495 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Syce1Q9D495 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Syce1Q9D495 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Syce1Q9D495 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Syce1Q9D495 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Syce1Q9D495 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Syce1Q9D495 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Syce1Q9D495 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Syce1Q9D495 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Syce1Q9D495 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Syce1Q9D495 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Syce1Q9D495 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Syce1Q9D495 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Syce1Q9D495 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Syce1Q9D495 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Syce1Q9D495 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Syce1Q9D495 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Syce1Q9D495 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Syce1Q9D495 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Syce1Q9D495 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Syce1Q9D495 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Syce1Q9D495 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Syce1Q9D495 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Syce1Q9D495 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Syce1Q9D495 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Syce1Q9D495 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Syce1Q9D495 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Syce1Q9D495 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Syce1Q9D495 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Syce1Q9D495 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Syce1Q9D495 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Syce1Q9D495 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Syce1Q9D495 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Syce1Q9D495 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Syce1Q9D495 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Syce1Q9D495 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Syce1Q9D495 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Syce1Q9D495 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Syce1Q9D495 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Syce1Q9D495 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Syce1Q9D495 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Syce1Q9D495 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Syce1Q9D495 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Syce1Q9D495 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Syce1Q9D495 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Syce1Q9D495 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Syce1Q9D495 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Syce1Q9D495 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Syce1Q9D495 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Syce1Q9D495 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Syce1Q9D495 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Syce1Q9D495 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Syce1Q9D495 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Syce1Q9D495 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Syce1Q9D495 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Syce1Q9D495 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Syce1Q9D495 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Syce1Q9D495 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Syce1Q9D495 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Syce1Q9D495 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Syce1Q9D495 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Syce1Q9D495 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Syce1Q9D495 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Syce1Q9D495 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Syce1Q9D495 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms