Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3T1

4933436I01Rik, RIKEN cDNA 4933436I01, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933436I01RikQ9D3T1 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
4933436I01RikQ9D3T1 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
4933436I01RikQ9D3T1 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
4933436I01RikQ9D3T1 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
4933436I01RikQ9D3T1 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
4933436I01RikQ9D3T1 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
4933436I01RikQ9D3T1 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
4933436I01RikQ9D3T1 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
4933436I01RikQ9D3T1 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
4933436I01RikQ9D3T1 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
4933436I01RikQ9D3T1 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
4933436I01RikQ9D3T1 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
4933436I01RikQ9D3T1 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
4933436I01RikQ9D3T1 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
4933436I01RikQ9D3T1 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
4933436I01RikQ9D3T1 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
4933436I01RikQ9D3T1 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
4933436I01RikQ9D3T1 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
4933436I01RikQ9D3T1 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
4933436I01RikQ9D3T1 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
4933436I01RikQ9D3T1 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
4933436I01RikQ9D3T1 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
4933436I01RikQ9D3T1 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
4933436I01RikQ9D3T1 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
4933436I01RikQ9D3T1 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
4933436I01RikQ9D3T1 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
4933436I01RikQ9D3T1 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
4933436I01RikQ9D3T1 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
4933436I01RikQ9D3T1 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
4933436I01RikQ9D3T1 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
4933436I01RikQ9D3T1 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
4933436I01RikQ9D3T1 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
4933436I01RikQ9D3T1 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
4933436I01RikQ9D3T1 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
4933436I01RikQ9D3T1 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
4933436I01RikQ9D3T1 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
4933436I01RikQ9D3T1 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
4933436I01RikQ9D3T1 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
4933436I01RikQ9D3T1 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
4933436I01RikQ9D3T1 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
4933436I01RikQ9D3T1 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
4933436I01RikQ9D3T1 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
4933436I01RikQ9D3T1 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
4933436I01RikQ9D3T1 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
4933436I01RikQ9D3T1 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
4933436I01RikQ9D3T1 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
4933436I01RikQ9D3T1 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
4933436I01RikQ9D3T1 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
4933436I01RikQ9D3T1 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
4933436I01RikQ9D3T1 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
4933436I01RikQ9D3T1 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
4933436I01RikQ9D3T1 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
4933436I01RikQ9D3T1 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
4933436I01RikQ9D3T1 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
4933436I01RikQ9D3T1 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
4933436I01RikQ9D3T1 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
4933436I01RikQ9D3T1 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
4933436I01RikQ9D3T1 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
4933436I01RikQ9D3T1 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
4933436I01RikQ9D3T1 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
4933436I01RikQ9D3T1 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
4933436I01RikQ9D3T1 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
4933436I01RikQ9D3T1 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
4933436I01RikQ9D3T1 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
4933436I01RikQ9D3T1 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
4933436I01RikQ9D3T1 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
4933436I01RikQ9D3T1 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
4933436I01RikQ9D3T1 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
4933436I01RikQ9D3T1 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
4933436I01RikQ9D3T1 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
4933436I01RikQ9D3T1 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
4933436I01RikQ9D3T1 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
4933436I01RikQ9D3T1 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
4933436I01RikQ9D3T1 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
4933436I01RikQ9D3T1 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
4933436I01RikQ9D3T1 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
4933436I01RikQ9D3T1 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
4933436I01RikQ9D3T1 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
4933436I01RikQ9D3T1 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
4933436I01RikQ9D3T1 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
4933436I01RikQ9D3T1 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
4933436I01RikQ9D3T1 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
4933436I01RikQ9D3T1 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
4933436I01RikQ9D3T1 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
4933436I01RikQ9D3T1 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
4933436I01RikQ9D3T1 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
4933436I01RikQ9D3T1 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
4933436I01RikQ9D3T1 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
4933436I01RikQ9D3T1 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
4933436I01RikQ9D3T1 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
4933436I01RikQ9D3T1 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
4933436I01RikQ9D3T1 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
4933436I01RikQ9D3T1 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
4933436I01RikQ9D3T1 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
4933436I01RikQ9D3T1 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
4933436I01RikQ9D3T1 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
4933436I01RikQ9D3T1 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
4933436I01RikQ9D3T1 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
4933436I01RikQ9D3T1 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
4933436I01RikQ9D3T1 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms