Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3E6

Stag1, Cohesin subunit SA-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stag1Q9D3E6 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Stag1Q9D3E6 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Stag1Q9D3E6 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Stag1Q9D3E6 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Stag1Q9D3E6 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Stag1Q9D3E6 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Stag1Q9D3E6 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Stag1Q9D3E6 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Stag1Q9D3E6 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Stag1Q9D3E6 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Stag1Q9D3E6 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Stag1Q9D3E6 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Stag1Q9D3E6 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Stag1Q9D3E6 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Stag1Q9D3E6 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Stag1Q9D3E6 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Stag1Q9D3E6 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Stag1Q9D3E6 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Stag1Q9D3E6 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Stag1Q9D3E6 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Stag1Q9D3E6 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Stag1Q9D3E6 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Stag1Q9D3E6 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Stag1Q9D3E6 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Stag1Q9D3E6 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Stag1Q9D3E6 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Stag1Q9D3E6 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Stag1Q9D3E6 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Stag1Q9D3E6 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Stag1Q9D3E6 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Stag1Q9D3E6 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Stag1Q9D3E6 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Stag1Q9D3E6 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Stag1Q9D3E6 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Stag1Q9D3E6 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Stag1Q9D3E6 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Stag1Q9D3E6 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Stag1Q9D3E6 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Stag1Q9D3E6 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Stag1Q9D3E6 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Stag1Q9D3E6 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Stag1Q9D3E6 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Stag1Q9D3E6 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Stag1Q9D3E6 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Stag1Q9D3E6 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Stag1Q9D3E6 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Stag1Q9D3E6 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Stag1Q9D3E6 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Stag1Q9D3E6 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Stag1Q9D3E6 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Stag1Q9D3E6 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Stag1Q9D3E6 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Stag1Q9D3E6 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Stag1Q9D3E6 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Stag1Q9D3E6 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Stag1Q9D3E6 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Stag1Q9D3E6 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Stag1Q9D3E6 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Stag1Q9D3E6 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Stag1Q9D3E6 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Stag1Q9D3E6 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Stag1Q9D3E6 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Stag1Q9D3E6 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Stag1Q9D3E6 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Stag1Q9D3E6 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Stag1Q9D3E6 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Stag1Q9D3E6 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Stag1Q9D3E6 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Stag1Q9D3E6 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Stag1Q9D3E6 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Stag1Q9D3E6 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Stag1Q9D3E6 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Stag1Q9D3E6 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Stag1Q9D3E6 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Stag1Q9D3E6 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Stag1Q9D3E6 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Stag1Q9D3E6 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Stag1Q9D3E6 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Stag1Q9D3E6 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Stag1Q9D3E6 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Stag1Q9D3E6 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Stag1Q9D3E6 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Stag1Q9D3E6 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Stag1Q9D3E6 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Stag1Q9D3E6 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Stag1Q9D3E6 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Stag1Q9D3E6 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Stag1Q9D3E6 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Stag1Q9D3E6 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Stag1Q9D3E6 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Stag1Q9D3E6 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Stag1Q9D3E6 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Stag1Q9D3E6 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Stag1Q9D3E6 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Stag1Q9D3E6 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Stag1Q9D3E6 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Stag1Q9D3E6 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Stag1Q9D3E6 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Stag1Q9D3E6 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Stag1Q9D3E6 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms