Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2Q3

Uncharacterized protein C10orf88 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D2Q3 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q9D2Q3 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q9D2Q3 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q9D2Q3 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Q9D2Q3 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q9D2Q3 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q9D2Q3 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q9D2Q3 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q9D2Q3 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q9D2Q3 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q9D2Q3 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q9D2Q3 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q9D2Q3 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q9D2Q3 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q9D2Q3 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q9D2Q3 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q9D2Q3 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q9D2Q3 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q9D2Q3 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q9D2Q3 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q9D2Q3 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Q9D2Q3 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q9D2Q3 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q9D2Q3 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q9D2Q3 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q9D2Q3 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q9D2Q3 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q9D2Q3 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q9D2Q3 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q9D2Q3 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q9D2Q3 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q9D2Q3 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Q9D2Q3 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q9D2Q3 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q9D2Q3 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q9D2Q3 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Q9D2Q3 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q9D2Q3 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q9D2Q3 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q9D2Q3 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q9D2Q3 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q9D2Q3 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Q9D2Q3 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q9D2Q3 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q9D2Q3 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q9D2Q3 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q9D2Q3 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q9D2Q3 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q9D2Q3 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q9D2Q3 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q9D2Q3 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q9D2Q3 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q9D2Q3 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q9D2Q3 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q9D2Q3 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q9D2Q3 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q9D2Q3 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q9D2Q3 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q9D2Q3 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q9D2Q3 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q9D2Q3 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q9D2Q3 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q9D2Q3 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q9D2Q3 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q9D2Q3 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q9D2Q3 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q9D2Q3 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q9D2Q3 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q9D2Q3 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q9D2Q3 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q9D2Q3 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q9D2Q3 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q9D2Q3 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q9D2Q3 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q9D2Q3 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q9D2Q3 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q9D2Q3 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q9D2Q3 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q9D2Q3 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q9D2Q3 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q9D2Q3 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q9D2Q3 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q9D2Q3 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q9D2Q3 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q9D2Q3 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q9D2Q3 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q9D2Q3 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q9D2Q3 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q9D2Q3 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q9D2Q3 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Q9D2Q3 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q9D2Q3 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q9D2Q3 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q9D2Q3 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q9D2Q3 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q9D2Q3 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q9D2Q3 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q9D2Q3 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Q9D2Q3 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Q9D2Q3 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms