Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1Q6

Erp44, Endoplasmic reticulum resident protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Erp44Q9D1Q6 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Erp44Q9D1Q6 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Erp44Q9D1Q6 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Erp44Q9D1Q6 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Erp44Q9D1Q6 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Erp44Q9D1Q6 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Erp44Q9D1Q6 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Erp44Q9D1Q6 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Erp44Q9D1Q6 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Erp44Q9D1Q6 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Erp44Q9D1Q6 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Erp44Q9D1Q6 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Erp44Q9D1Q6 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Erp44Q9D1Q6 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Erp44Q9D1Q6 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Erp44Q9D1Q6 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Erp44Q9D1Q6 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Erp44Q9D1Q6 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Erp44Q9D1Q6 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Erp44Q9D1Q6 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Erp44Q9D1Q6 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Erp44Q9D1Q6 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Erp44Q9D1Q6 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Erp44Q9D1Q6 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Erp44Q9D1Q6 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Erp44Q9D1Q6 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Erp44Q9D1Q6 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Erp44Q9D1Q6 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Erp44Q9D1Q6 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Erp44Q9D1Q6 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Erp44Q9D1Q6 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Erp44Q9D1Q6 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Erp44Q9D1Q6 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Erp44Q9D1Q6 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Erp44Q9D1Q6 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Erp44Q9D1Q6 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Erp44Q9D1Q6 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Erp44Q9D1Q6 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Erp44Q9D1Q6 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Erp44Q9D1Q6 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Erp44Q9D1Q6 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Erp44Q9D1Q6 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Erp44Q9D1Q6 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Erp44Q9D1Q6 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Erp44Q9D1Q6 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Erp44Q9D1Q6 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Erp44Q9D1Q6 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Erp44Q9D1Q6 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Erp44Q9D1Q6 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Erp44Q9D1Q6 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Erp44Q9D1Q6 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Erp44Q9D1Q6 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Erp44Q9D1Q6 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Erp44Q9D1Q6 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Erp44Q9D1Q6 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Erp44Q9D1Q6 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Erp44Q9D1Q6 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Erp44Q9D1Q6 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Erp44Q9D1Q6 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Erp44Q9D1Q6 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Erp44Q9D1Q6 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Erp44Q9D1Q6 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Erp44Q9D1Q6 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Erp44Q9D1Q6 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Erp44Q9D1Q6 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Erp44Q9D1Q6 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Erp44Q9D1Q6 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Erp44Q9D1Q6 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Erp44Q9D1Q6 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Erp44Q9D1Q6 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Erp44Q9D1Q6 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Erp44Q9D1Q6 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Erp44Q9D1Q6 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Erp44Q9D1Q6 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Erp44Q9D1Q6 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Erp44Q9D1Q6 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Erp44Q9D1Q6 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Erp44Q9D1Q6 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Erp44Q9D1Q6 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Erp44Q9D1Q6 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Erp44Q9D1Q6 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Erp44Q9D1Q6 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Erp44Q9D1Q6 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Erp44Q9D1Q6 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Erp44Q9D1Q6 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Erp44Q9D1Q6 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Erp44Q9D1Q6 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Erp44Q9D1Q6 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Erp44Q9D1Q6 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Erp44Q9D1Q6 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Erp44Q9D1Q6 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Erp44Q9D1Q6 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Erp44Q9D1Q6 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Erp44Q9D1Q6 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Erp44Q9D1Q6 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Erp44Q9D1Q6 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Erp44Q9D1Q6 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Erp44Q9D1Q6 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Erp44Q9D1Q6 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Erp44Q9D1Q6 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms