Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1L0

Chchd2, Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 153 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chchd2Q9D1L0 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chchd2Q9D1L0 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chchd2Q9D1L0 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chchd2Q9D1L0 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chchd2Q9D1L0 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chchd2Q9D1L0 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chchd2Q9D1L0 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Chchd2Q9D1L0 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chchd2Q9D1L0 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chchd2Q9D1L0 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chchd2Q9D1L0 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chchd2Q9D1L0 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Chchd2Q9D1L0 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Chchd2Q9D1L0 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chchd2Q9D1L0 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chchd2Q9D1L0 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chchd2Q9D1L0 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chchd2Q9D1L0 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chchd2Q9D1L0 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chchd2Q9D1L0 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chchd2Q9D1L0 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chchd2Q9D1L0 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chchd2Q9D1L0 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chchd2Q9D1L0 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chchd2Q9D1L0 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chchd2Q9D1L0 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chchd2Q9D1L0 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Chchd2Q9D1L0 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chchd2Q9D1L0 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chchd2Q9D1L0 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chchd2Q9D1L0 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chchd2Q9D1L0 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chchd2Q9D1L0 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chchd2Q9D1L0 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chchd2Q9D1L0 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Chchd2Q9D1L0 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Chchd2Q9D1L0 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Chchd2Q9D1L0 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chchd2Q9D1L0 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chchd2Q9D1L0 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chchd2Q9D1L0 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chchd2Q9D1L0 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Chchd2Q9D1L0 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Chchd2Q9D1L0 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chchd2Q9D1L0 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chchd2Q9D1L0 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chchd2Q9D1L0 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chchd2Q9D1L0 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chchd2Q9D1L0 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Chchd2Q9D1L0 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chchd2Q9D1L0 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Chchd2Q9D1L0 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chchd2Q9D1L0 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Chchd2Q9D1L0 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chchd2Q9D1L0 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chchd2Q9D1L0 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chchd2Q9D1L0 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chchd2Q9D1L0 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chchd2Q9D1L0 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chchd2Q9D1L0 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chchd2Q9D1L0 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chchd2Q9D1L0 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chchd2Q9D1L0 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chchd2Q9D1L0 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chchd2Q9D1L0 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chchd2Q9D1L0 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chchd2Q9D1L0 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chchd2Q9D1L0 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chchd2Q9D1L0 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chchd2Q9D1L0 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chchd2Q9D1L0 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chchd2Q9D1L0 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chchd2Q9D1L0 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chchd2Q9D1L0 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chchd2Q9D1L0 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chchd2Q9D1L0 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chchd2Q9D1L0 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chchd2Q9D1L0 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chchd2Q9D1L0 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chchd2Q9D1L0 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chchd2Q9D1L0 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chchd2Q9D1L0 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chchd2Q9D1L0 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chchd2Q9D1L0 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chchd2Q9D1L0 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chchd2Q9D1L0 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chchd2Q9D1L0 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chchd2Q9D1L0 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chchd2Q9D1L0 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chchd2Q9D1L0 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chchd2Q9D1L0 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chchd2Q9D1L0 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chchd2Q9D1L0 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chchd2Q9D1L0 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chchd2Q9D1L0 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chchd2Q9D1L0 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chchd2Q9D1L0 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chchd2Q9D1L0 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chchd2Q9D1L0 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chchd2Q9D1L0 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms