Protein–RNA interactions for Protein: Q9D114

Hddc3, Guanosine-3',5'-bis(diphosphate) 3'-pyrophosphohydrolase MESH1, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc3Q9D114 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hddc3Q9D114 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hddc3Q9D114 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hddc3Q9D114 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hddc3Q9D114 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hddc3Q9D114 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hddc3Q9D114 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Hddc3Q9D114 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hddc3Q9D114 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hddc3Q9D114 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hddc3Q9D114 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hddc3Q9D114 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hddc3Q9D114 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hddc3Q9D114 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Hddc3Q9D114 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hddc3Q9D114 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hddc3Q9D114 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hddc3Q9D114 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hddc3Q9D114 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hddc3Q9D114 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hddc3Q9D114 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hddc3Q9D114 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hddc3Q9D114 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hddc3Q9D114 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hddc3Q9D114 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hddc3Q9D114 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hddc3Q9D114 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hddc3Q9D114 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hddc3Q9D114 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hddc3Q9D114 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hddc3Q9D114 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hddc3Q9D114 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Hddc3Q9D114 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Hddc3Q9D114 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Hddc3Q9D114 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Hddc3Q9D114 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Hddc3Q9D114 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Hddc3Q9D114 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Hddc3Q9D114 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hddc3Q9D114 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hddc3Q9D114 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hddc3Q9D114 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hddc3Q9D114 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hddc3Q9D114 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hddc3Q9D114 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hddc3Q9D114 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hddc3Q9D114 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hddc3Q9D114 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hddc3Q9D114 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hddc3Q9D114 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hddc3Q9D114 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hddc3Q9D114 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hddc3Q9D114 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hddc3Q9D114 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hddc3Q9D114 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hddc3Q9D114 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hddc3Q9D114 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hddc3Q9D114 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hddc3Q9D114 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hddc3Q9D114 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hddc3Q9D114 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hddc3Q9D114 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Hddc3Q9D114 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Hddc3Q9D114 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hddc3Q9D114 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Hddc3Q9D114 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hddc3Q9D114 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hddc3Q9D114 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hddc3Q9D114 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hddc3Q9D114 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hddc3Q9D114 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hddc3Q9D114 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hddc3Q9D114 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hddc3Q9D114 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hddc3Q9D114 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hddc3Q9D114 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hddc3Q9D114 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hddc3Q9D114 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hddc3Q9D114 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hddc3Q9D114 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hddc3Q9D114 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hddc3Q9D114 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hddc3Q9D114 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hddc3Q9D114 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Hddc3Q9D114 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hddc3Q9D114 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hddc3Q9D114 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hddc3Q9D114 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hddc3Q9D114 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hddc3Q9D114 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hddc3Q9D114 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hddc3Q9D114 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hddc3Q9D114 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hddc3Q9D114 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hddc3Q9D114 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hddc3Q9D114 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hddc3Q9D114 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hddc3Q9D114 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hddc3Q9D114 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hddc3Q9D114 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms