Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0B6

Pbdc1, Protein PBDC1, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pbdc1Q9D0B6 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pbdc1Q9D0B6 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pbdc1Q9D0B6 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pbdc1Q9D0B6 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pbdc1Q9D0B6 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pbdc1Q9D0B6 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pbdc1Q9D0B6 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pbdc1Q9D0B6 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pbdc1Q9D0B6 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pbdc1Q9D0B6 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pbdc1Q9D0B6 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pbdc1Q9D0B6 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pbdc1Q9D0B6 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pbdc1Q9D0B6 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pbdc1Q9D0B6 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pbdc1Q9D0B6 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Pbdc1Q9D0B6 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Pbdc1Q9D0B6 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pbdc1Q9D0B6 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pbdc1Q9D0B6 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pbdc1Q9D0B6 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pbdc1Q9D0B6 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pbdc1Q9D0B6 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pbdc1Q9D0B6 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pbdc1Q9D0B6 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pbdc1Q9D0B6 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pbdc1Q9D0B6 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pbdc1Q9D0B6 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pbdc1Q9D0B6 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pbdc1Q9D0B6 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pbdc1Q9D0B6 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pbdc1Q9D0B6 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pbdc1Q9D0B6 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pbdc1Q9D0B6 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pbdc1Q9D0B6 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pbdc1Q9D0B6 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pbdc1Q9D0B6 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pbdc1Q9D0B6 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pbdc1Q9D0B6 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pbdc1Q9D0B6 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pbdc1Q9D0B6 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pbdc1Q9D0B6 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pbdc1Q9D0B6 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pbdc1Q9D0B6 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pbdc1Q9D0B6 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pbdc1Q9D0B6 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Pbdc1Q9D0B6 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pbdc1Q9D0B6 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pbdc1Q9D0B6 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pbdc1Q9D0B6 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pbdc1Q9D0B6 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pbdc1Q9D0B6 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Pbdc1Q9D0B6 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Pbdc1Q9D0B6 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Pbdc1Q9D0B6 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Pbdc1Q9D0B6 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Pbdc1Q9D0B6 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pbdc1Q9D0B6 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pbdc1Q9D0B6 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Pbdc1Q9D0B6 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pbdc1Q9D0B6 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pbdc1Q9D0B6 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pbdc1Q9D0B6 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pbdc1Q9D0B6 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pbdc1Q9D0B6 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pbdc1Q9D0B6 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pbdc1Q9D0B6 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pbdc1Q9D0B6 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pbdc1Q9D0B6 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pbdc1Q9D0B6 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pbdc1Q9D0B6 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pbdc1Q9D0B6 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pbdc1Q9D0B6 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pbdc1Q9D0B6 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Pbdc1Q9D0B6 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pbdc1Q9D0B6 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pbdc1Q9D0B6 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pbdc1Q9D0B6 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pbdc1Q9D0B6 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pbdc1Q9D0B6 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pbdc1Q9D0B6 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pbdc1Q9D0B6 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pbdc1Q9D0B6 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pbdc1Q9D0B6 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pbdc1Q9D0B6 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pbdc1Q9D0B6 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pbdc1Q9D0B6 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pbdc1Q9D0B6 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pbdc1Q9D0B6 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pbdc1Q9D0B6 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pbdc1Q9D0B6 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pbdc1Q9D0B6 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pbdc1Q9D0B6 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pbdc1Q9D0B6 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pbdc1Q9D0B6 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pbdc1Q9D0B6 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pbdc1Q9D0B6 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pbdc1Q9D0B6 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pbdc1Q9D0B6 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pbdc1Q9D0B6 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms