Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYY7

Prelid3b, PRELI domain containing protein 3B, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prelid3bQ9CYY7 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prelid3bQ9CYY7 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prelid3bQ9CYY7 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prelid3bQ9CYY7 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prelid3bQ9CYY7 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prelid3bQ9CYY7 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prelid3bQ9CYY7 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prelid3bQ9CYY7 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prelid3bQ9CYY7 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prelid3bQ9CYY7 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Prelid3bQ9CYY7 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Prelid3bQ9CYY7 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prelid3bQ9CYY7 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prelid3bQ9CYY7 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prelid3bQ9CYY7 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prelid3bQ9CYY7 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prelid3bQ9CYY7 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prelid3bQ9CYY7 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prelid3bQ9CYY7 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prelid3bQ9CYY7 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prelid3bQ9CYY7 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prelid3bQ9CYY7 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prelid3bQ9CYY7 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prelid3bQ9CYY7 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prelid3bQ9CYY7 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prelid3bQ9CYY7 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prelid3bQ9CYY7 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prelid3bQ9CYY7 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prelid3bQ9CYY7 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prelid3bQ9CYY7 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prelid3bQ9CYY7 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prelid3bQ9CYY7 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prelid3bQ9CYY7 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prelid3bQ9CYY7 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prelid3bQ9CYY7 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prelid3bQ9CYY7 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prelid3bQ9CYY7 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prelid3bQ9CYY7 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prelid3bQ9CYY7 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prelid3bQ9CYY7 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prelid3bQ9CYY7 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prelid3bQ9CYY7 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prelid3bQ9CYY7 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prelid3bQ9CYY7 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prelid3bQ9CYY7 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prelid3bQ9CYY7 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prelid3bQ9CYY7 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prelid3bQ9CYY7 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prelid3bQ9CYY7 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prelid3bQ9CYY7 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prelid3bQ9CYY7 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prelid3bQ9CYY7 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prelid3bQ9CYY7 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prelid3bQ9CYY7 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Prelid3bQ9CYY7 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prelid3bQ9CYY7 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prelid3bQ9CYY7 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prelid3bQ9CYY7 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prelid3bQ9CYY7 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Prelid3bQ9CYY7 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prelid3bQ9CYY7 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prelid3bQ9CYY7 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prelid3bQ9CYY7 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prelid3bQ9CYY7 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prelid3bQ9CYY7 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prelid3bQ9CYY7 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prelid3bQ9CYY7 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prelid3bQ9CYY7 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prelid3bQ9CYY7 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prelid3bQ9CYY7 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prelid3bQ9CYY7 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Prelid3bQ9CYY7 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Prelid3bQ9CYY7 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prelid3bQ9CYY7 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prelid3bQ9CYY7 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prelid3bQ9CYY7 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prelid3bQ9CYY7 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prelid3bQ9CYY7 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prelid3bQ9CYY7 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prelid3bQ9CYY7 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prelid3bQ9CYY7 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prelid3bQ9CYY7 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prelid3bQ9CYY7 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prelid3bQ9CYY7 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prelid3bQ9CYY7 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prelid3bQ9CYY7 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prelid3bQ9CYY7 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Prelid3bQ9CYY7 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prelid3bQ9CYY7 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prelid3bQ9CYY7 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prelid3bQ9CYY7 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prelid3bQ9CYY7 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prelid3bQ9CYY7 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prelid3bQ9CYY7 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prelid3bQ9CYY7 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Prelid3bQ9CYY7 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prelid3bQ9CYY7 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prelid3bQ9CYY7 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prelid3bQ9CYY7 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prelid3bQ9CYY7 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms