Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY21

Bud23, Probable 18S rRNA (guanine-N(7))-methyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bud23Q9CY21 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bud23Q9CY21 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bud23Q9CY21 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bud23Q9CY21 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bud23Q9CY21 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bud23Q9CY21 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bud23Q9CY21 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bud23Q9CY21 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bud23Q9CY21 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bud23Q9CY21 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bud23Q9CY21 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bud23Q9CY21 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bud23Q9CY21 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Bud23Q9CY21 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bud23Q9CY21 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Bud23Q9CY21 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bud23Q9CY21 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bud23Q9CY21 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Bud23Q9CY21 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Bud23Q9CY21 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bud23Q9CY21 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Bud23Q9CY21 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bud23Q9CY21 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bud23Q9CY21 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bud23Q9CY21 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bud23Q9CY21 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bud23Q9CY21 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bud23Q9CY21 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bud23Q9CY21 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Bud23Q9CY21 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bud23Q9CY21 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bud23Q9CY21 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bud23Q9CY21 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bud23Q9CY21 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bud23Q9CY21 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bud23Q9CY21 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bud23Q9CY21 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bud23Q9CY21 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bud23Q9CY21 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bud23Q9CY21 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bud23Q9CY21 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bud23Q9CY21 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bud23Q9CY21 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bud23Q9CY21 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bud23Q9CY21 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bud23Q9CY21 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bud23Q9CY21 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bud23Q9CY21 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bud23Q9CY21 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bud23Q9CY21 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bud23Q9CY21 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bud23Q9CY21 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bud23Q9CY21 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bud23Q9CY21 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bud23Q9CY21 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bud23Q9CY21 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bud23Q9CY21 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bud23Q9CY21 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bud23Q9CY21 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bud23Q9CY21 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bud23Q9CY21 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bud23Q9CY21 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bud23Q9CY21 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bud23Q9CY21 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bud23Q9CY21 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Bud23Q9CY21 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bud23Q9CY21 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bud23Q9CY21 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bud23Q9CY21 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Bud23Q9CY21 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Bud23Q9CY21 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Bud23Q9CY21 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Bud23Q9CY21 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Bud23Q9CY21 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Bud23Q9CY21 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Bud23Q9CY21 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Bud23Q9CY21 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Bud23Q9CY21 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Bud23Q9CY21 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Bud23Q9CY21 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Bud23Q9CY21 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Bud23Q9CY21 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Bud23Q9CY21 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Bud23Q9CY21 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Bud23Q9CY21 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Bud23Q9CY21 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Bud23Q9CY21 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Bud23Q9CY21 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Bud23Q9CY21 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Bud23Q9CY21 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Bud23Q9CY21 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Bud23Q9CY21 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Bud23Q9CY21 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Bud23Q9CY21 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Bud23Q9CY21 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Bud23Q9CY21 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Bud23Q9CY21 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Bud23Q9CY21 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Bud23Q9CY21 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Bud23Q9CY21 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms