Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU0

Tdrd12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, mousemouse

Predictions only

Length 1,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd12Q9CWU0 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tdrd12Q9CWU0 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tdrd12Q9CWU0 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tdrd12Q9CWU0 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tdrd12Q9CWU0 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tdrd12Q9CWU0 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tdrd12Q9CWU0 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tdrd12Q9CWU0 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Tdrd12Q9CWU0 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tdrd12Q9CWU0 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tdrd12Q9CWU0 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tdrd12Q9CWU0 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tdrd12Q9CWU0 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tdrd12Q9CWU0 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tdrd12Q9CWU0 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tdrd12Q9CWU0 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tdrd12Q9CWU0 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tdrd12Q9CWU0 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tdrd12Q9CWU0 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tdrd12Q9CWU0 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tdrd12Q9CWU0 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tdrd12Q9CWU0 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tdrd12Q9CWU0 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tdrd12Q9CWU0 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tdrd12Q9CWU0 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tdrd12Q9CWU0 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tdrd12Q9CWU0 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tdrd12Q9CWU0 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tdrd12Q9CWU0 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tdrd12Q9CWU0 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tdrd12Q9CWU0 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tdrd12Q9CWU0 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tdrd12Q9CWU0 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tdrd12Q9CWU0 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tdrd12Q9CWU0 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tdrd12Q9CWU0 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tdrd12Q9CWU0 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tdrd12Q9CWU0 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Tdrd12Q9CWU0 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tdrd12Q9CWU0 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tdrd12Q9CWU0 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tdrd12Q9CWU0 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tdrd12Q9CWU0 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tdrd12Q9CWU0 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tdrd12Q9CWU0 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tdrd12Q9CWU0 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tdrd12Q9CWU0 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tdrd12Q9CWU0 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tdrd12Q9CWU0 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tdrd12Q9CWU0 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tdrd12Q9CWU0 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Tdrd12Q9CWU0 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tdrd12Q9CWU0 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tdrd12Q9CWU0 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Tdrd12Q9CWU0 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Tdrd12Q9CWU0 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tdrd12Q9CWU0 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tdrd12Q9CWU0 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tdrd12Q9CWU0 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tdrd12Q9CWU0 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tdrd12Q9CWU0 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tdrd12Q9CWU0 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tdrd12Q9CWU0 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tdrd12Q9CWU0 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tdrd12Q9CWU0 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tdrd12Q9CWU0 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tdrd12Q9CWU0 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tdrd12Q9CWU0 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tdrd12Q9CWU0 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tdrd12Q9CWU0 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tdrd12Q9CWU0 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tdrd12Q9CWU0 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tdrd12Q9CWU0 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tdrd12Q9CWU0 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tdrd12Q9CWU0 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Tdrd12Q9CWU0 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Tdrd12Q9CWU0 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tdrd12Q9CWU0 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tdrd12Q9CWU0 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tdrd12Q9CWU0 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tdrd12Q9CWU0 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tdrd12Q9CWU0 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tdrd12Q9CWU0 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tdrd12Q9CWU0 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tdrd12Q9CWU0 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tdrd12Q9CWU0 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tdrd12Q9CWU0 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tdrd12Q9CWU0 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tdrd12Q9CWU0 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tdrd12Q9CWU0 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tdrd12Q9CWU0 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tdrd12Q9CWU0 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Tdrd12Q9CWU0 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tdrd12Q9CWU0 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Tdrd12Q9CWU0 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tdrd12Q9CWU0 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tdrd12Q9CWU0 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tdrd12Q9CWU0 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tdrd12Q9CWU0 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tdrd12Q9CWU0 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms