Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWT3

Snx10, Sorting nexin-10, mousemouse

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Length 201 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx10Q9CWT3 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snx10Q9CWT3 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snx10Q9CWT3 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snx10Q9CWT3 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Snx10Q9CWT3 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Snx10Q9CWT3 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Snx10Q9CWT3 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Snx10Q9CWT3 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Snx10Q9CWT3 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Snx10Q9CWT3 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Snx10Q9CWT3 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Snx10Q9CWT3 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Snx10Q9CWT3 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Snx10Q9CWT3 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Snx10Q9CWT3 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Snx10Q9CWT3 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Snx10Q9CWT3 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Snx10Q9CWT3 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Snx10Q9CWT3 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Snx10Q9CWT3 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Snx10Q9CWT3 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Snx10Q9CWT3 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Snx10Q9CWT3 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Snx10Q9CWT3 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Snx10Q9CWT3 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Snx10Q9CWT3 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Snx10Q9CWT3 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Snx10Q9CWT3 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Snx10Q9CWT3 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Snx10Q9CWT3 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Snx10Q9CWT3 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Snx10Q9CWT3 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Snx10Q9CWT3 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Snx10Q9CWT3 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Snx10Q9CWT3 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Snx10Q9CWT3 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Snx10Q9CWT3 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Snx10Q9CWT3 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Snx10Q9CWT3 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Snx10Q9CWT3 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Snx10Q9CWT3 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Snx10Q9CWT3 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Snx10Q9CWT3 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Snx10Q9CWT3 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Snx10Q9CWT3 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Snx10Q9CWT3 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Snx10Q9CWT3 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Snx10Q9CWT3 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Snx10Q9CWT3 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Snx10Q9CWT3 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Snx10Q9CWT3 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Snx10Q9CWT3 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Snx10Q9CWT3 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Snx10Q9CWT3 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Snx10Q9CWT3 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Snx10Q9CWT3 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Snx10Q9CWT3 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Snx10Q9CWT3 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Snx10Q9CWT3 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Snx10Q9CWT3 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Snx10Q9CWT3 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Snx10Q9CWT3 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Snx10Q9CWT3 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Snx10Q9CWT3 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Snx10Q9CWT3 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Snx10Q9CWT3 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Snx10Q9CWT3 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Snx10Q9CWT3 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Snx10Q9CWT3 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Snx10Q9CWT3 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Snx10Q9CWT3 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Snx10Q9CWT3 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Snx10Q9CWT3 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Snx10Q9CWT3 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Snx10Q9CWT3 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Snx10Q9CWT3 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Snx10Q9CWT3 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Snx10Q9CWT3 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Snx10Q9CWT3 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Snx10Q9CWT3 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Snx10Q9CWT3 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Snx10Q9CWT3 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Snx10Q9CWT3 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Snx10Q9CWT3 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Snx10Q9CWT3 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Snx10Q9CWT3 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Snx10Q9CWT3 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Snx10Q9CWT3 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Snx10Q9CWT3 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Snx10Q9CWT3 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Snx10Q9CWT3 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Snx10Q9CWT3 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Snx10Q9CWT3 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Snx10Q9CWT3 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Snx10Q9CWT3 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Snx10Q9CWT3 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Snx10Q9CWT3 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Snx10Q9CWT3 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Snx10Q9CWT3 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Snx10Q9CWT3 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms