Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWM2

Cdca4, Cell division cycle-associated protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdca4Q9CWM2 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdca4Q9CWM2 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdca4Q9CWM2 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdca4Q9CWM2 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdca4Q9CWM2 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdca4Q9CWM2 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdca4Q9CWM2 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdca4Q9CWM2 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdca4Q9CWM2 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdca4Q9CWM2 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdca4Q9CWM2 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdca4Q9CWM2 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdca4Q9CWM2 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdca4Q9CWM2 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdca4Q9CWM2 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdca4Q9CWM2 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdca4Q9CWM2 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdca4Q9CWM2 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdca4Q9CWM2 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdca4Q9CWM2 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdca4Q9CWM2 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdca4Q9CWM2 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdca4Q9CWM2 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdca4Q9CWM2 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdca4Q9CWM2 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdca4Q9CWM2 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdca4Q9CWM2 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdca4Q9CWM2 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdca4Q9CWM2 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdca4Q9CWM2 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdca4Q9CWM2 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdca4Q9CWM2 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdca4Q9CWM2 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdca4Q9CWM2 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdca4Q9CWM2 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdca4Q9CWM2 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdca4Q9CWM2 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdca4Q9CWM2 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdca4Q9CWM2 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdca4Q9CWM2 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdca4Q9CWM2 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdca4Q9CWM2 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdca4Q9CWM2 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdca4Q9CWM2 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdca4Q9CWM2 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdca4Q9CWM2 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdca4Q9CWM2 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdca4Q9CWM2 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdca4Q9CWM2 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdca4Q9CWM2 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdca4Q9CWM2 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdca4Q9CWM2 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdca4Q9CWM2 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdca4Q9CWM2 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdca4Q9CWM2 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdca4Q9CWM2 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdca4Q9CWM2 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdca4Q9CWM2 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdca4Q9CWM2 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdca4Q9CWM2 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdca4Q9CWM2 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdca4Q9CWM2 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdca4Q9CWM2 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdca4Q9CWM2 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdca4Q9CWM2 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdca4Q9CWM2 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdca4Q9CWM2 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdca4Q9CWM2 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdca4Q9CWM2 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdca4Q9CWM2 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdca4Q9CWM2 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdca4Q9CWM2 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdca4Q9CWM2 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdca4Q9CWM2 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdca4Q9CWM2 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdca4Q9CWM2 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdca4Q9CWM2 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdca4Q9CWM2 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdca4Q9CWM2 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdca4Q9CWM2 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdca4Q9CWM2 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdca4Q9CWM2 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdca4Q9CWM2 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdca4Q9CWM2 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdca4Q9CWM2 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdca4Q9CWM2 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdca4Q9CWM2 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdca4Q9CWM2 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdca4Q9CWM2 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdca4Q9CWM2 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdca4Q9CWM2 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdca4Q9CWM2 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdca4Q9CWM2 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdca4Q9CWM2 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdca4Q9CWM2 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdca4Q9CWM2 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdca4Q9CWM2 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdca4Q9CWM2 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdca4Q9CWM2 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdca4Q9CWM2 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms