Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWD8

Nubpl, Iron-sulfur protein NUBPL, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NubplQ9CWD8 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NubplQ9CWD8 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NubplQ9CWD8 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NubplQ9CWD8 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NubplQ9CWD8 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NubplQ9CWD8 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NubplQ9CWD8 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NubplQ9CWD8 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NubplQ9CWD8 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NubplQ9CWD8 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NubplQ9CWD8 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NubplQ9CWD8 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NubplQ9CWD8 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NubplQ9CWD8 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NubplQ9CWD8 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NubplQ9CWD8 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NubplQ9CWD8 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NubplQ9CWD8 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NubplQ9CWD8 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NubplQ9CWD8 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NubplQ9CWD8 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NubplQ9CWD8 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NubplQ9CWD8 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NubplQ9CWD8 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NubplQ9CWD8 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NubplQ9CWD8 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NubplQ9CWD8 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NubplQ9CWD8 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NubplQ9CWD8 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NubplQ9CWD8 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NubplQ9CWD8 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NubplQ9CWD8 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NubplQ9CWD8 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NubplQ9CWD8 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NubplQ9CWD8 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NubplQ9CWD8 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NubplQ9CWD8 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NubplQ9CWD8 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NubplQ9CWD8 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NubplQ9CWD8 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NubplQ9CWD8 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NubplQ9CWD8 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NubplQ9CWD8 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NubplQ9CWD8 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NubplQ9CWD8 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NubplQ9CWD8 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NubplQ9CWD8 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NubplQ9CWD8 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NubplQ9CWD8 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NubplQ9CWD8 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NubplQ9CWD8 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NubplQ9CWD8 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NubplQ9CWD8 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NubplQ9CWD8 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NubplQ9CWD8 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NubplQ9CWD8 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NubplQ9CWD8 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NubplQ9CWD8 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NubplQ9CWD8 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NubplQ9CWD8 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NubplQ9CWD8 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NubplQ9CWD8 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NubplQ9CWD8 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NubplQ9CWD8 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NubplQ9CWD8 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NubplQ9CWD8 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NubplQ9CWD8 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NubplQ9CWD8 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NubplQ9CWD8 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NubplQ9CWD8 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NubplQ9CWD8 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NubplQ9CWD8 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NubplQ9CWD8 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NubplQ9CWD8 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NubplQ9CWD8 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NubplQ9CWD8 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NubplQ9CWD8 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NubplQ9CWD8 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NubplQ9CWD8 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NubplQ9CWD8 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NubplQ9CWD8 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NubplQ9CWD8 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NubplQ9CWD8 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NubplQ9CWD8 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NubplQ9CWD8 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NubplQ9CWD8 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NubplQ9CWD8 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NubplQ9CWD8 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NubplQ9CWD8 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NubplQ9CWD8 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
NubplQ9CWD8 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NubplQ9CWD8 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NubplQ9CWD8 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NubplQ9CWD8 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NubplQ9CWD8 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NubplQ9CWD8 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NubplQ9CWD8 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NubplQ9CWD8 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NubplQ9CWD8 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NubplQ9CWD8 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.5 ms