Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUH1

4930553M12Rik, RIKEN cDNA 4930553M12 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930553M12RikQ9CUH1 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
4930553M12RikQ9CUH1 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
4930553M12RikQ9CUH1 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
4930553M12RikQ9CUH1 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
4930553M12RikQ9CUH1 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
4930553M12RikQ9CUH1 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
4930553M12RikQ9CUH1 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
4930553M12RikQ9CUH1 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
4930553M12RikQ9CUH1 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
4930553M12RikQ9CUH1 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
4930553M12RikQ9CUH1 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
4930553M12RikQ9CUH1 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
4930553M12RikQ9CUH1 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
4930553M12RikQ9CUH1 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
4930553M12RikQ9CUH1 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
4930553M12RikQ9CUH1 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
4930553M12RikQ9CUH1 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
4930553M12RikQ9CUH1 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
4930553M12RikQ9CUH1 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
4930553M12RikQ9CUH1 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
4930553M12RikQ9CUH1 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
4930553M12RikQ9CUH1 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
4930553M12RikQ9CUH1 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
4930553M12RikQ9CUH1 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
4930553M12RikQ9CUH1 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
4930553M12RikQ9CUH1 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
4930553M12RikQ9CUH1 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
4930553M12RikQ9CUH1 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
4930553M12RikQ9CUH1 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
4930553M12RikQ9CUH1 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
4930553M12RikQ9CUH1 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
4930553M12RikQ9CUH1 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
4930553M12RikQ9CUH1 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
4930553M12RikQ9CUH1 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
4930553M12RikQ9CUH1 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
4930553M12RikQ9CUH1 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
4930553M12RikQ9CUH1 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
4930553M12RikQ9CUH1 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
4930553M12RikQ9CUH1 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
4930553M12RikQ9CUH1 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
4930553M12RikQ9CUH1 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
4930553M12RikQ9CUH1 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
4930553M12RikQ9CUH1 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
4930553M12RikQ9CUH1 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
4930553M12RikQ9CUH1 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
4930553M12RikQ9CUH1 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
4930553M12RikQ9CUH1 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
4930553M12RikQ9CUH1 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
4930553M12RikQ9CUH1 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
4930553M12RikQ9CUH1 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
4930553M12RikQ9CUH1 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
4930553M12RikQ9CUH1 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
4930553M12RikQ9CUH1 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
4930553M12RikQ9CUH1 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
4930553M12RikQ9CUH1 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
4930553M12RikQ9CUH1 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
4930553M12RikQ9CUH1 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
4930553M12RikQ9CUH1 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
4930553M12RikQ9CUH1 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
4930553M12RikQ9CUH1 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
4930553M12RikQ9CUH1 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
4930553M12RikQ9CUH1 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
4930553M12RikQ9CUH1 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
4930553M12RikQ9CUH1 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
4930553M12RikQ9CUH1 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
4930553M12RikQ9CUH1 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
4930553M12RikQ9CUH1 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
4930553M12RikQ9CUH1 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
4930553M12RikQ9CUH1 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
4930553M12RikQ9CUH1 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
4930553M12RikQ9CUH1 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
4930553M12RikQ9CUH1 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
4930553M12RikQ9CUH1 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
4930553M12RikQ9CUH1 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
4930553M12RikQ9CUH1 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
4930553M12RikQ9CUH1 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
4930553M12RikQ9CUH1 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
4930553M12RikQ9CUH1 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
4930553M12RikQ9CUH1 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
4930553M12RikQ9CUH1 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
4930553M12RikQ9CUH1 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
4930553M12RikQ9CUH1 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
4930553M12RikQ9CUH1 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
4930553M12RikQ9CUH1 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
4930553M12RikQ9CUH1 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
4930553M12RikQ9CUH1 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
4930553M12RikQ9CUH1 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
4930553M12RikQ9CUH1 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
4930553M12RikQ9CUH1 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
4930553M12RikQ9CUH1 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
4930553M12RikQ9CUH1 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
4930553M12RikQ9CUH1 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
4930553M12RikQ9CUH1 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
4930553M12RikQ9CUH1 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
4930553M12RikQ9CUH1 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
4930553M12RikQ9CUH1 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
4930553M12RikQ9CUH1 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
4930553M12RikQ9CUH1 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
4930553M12RikQ9CUH1 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
4930553M12RikQ9CUH1 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms