Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQP3

Chchd5, Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain-containing protein 5, mousemouse

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Length 110 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chchd5Q9CQP3 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Chchd5Q9CQP3 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Chchd5Q9CQP3 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Chchd5Q9CQP3 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Chchd5Q9CQP3 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Chchd5Q9CQP3 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Chchd5Q9CQP3 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Chchd5Q9CQP3 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Chchd5Q9CQP3 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Chchd5Q9CQP3 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC12.77□□□□□ -0.36
Chchd5Q9CQP3 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Chchd5Q9CQP3 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Chchd5Q9CQP3 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Chchd5Q9CQP3 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Chchd5Q9CQP3 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Chchd5Q9CQP3 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Chchd5Q9CQP3 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Chchd5Q9CQP3 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Chchd5Q9CQP3 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Chchd5Q9CQP3 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Chchd5Q9CQP3 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Chchd5Q9CQP3 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Chchd5Q9CQP3 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Chchd5Q9CQP3 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Chchd5Q9CQP3 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Chchd5Q9CQP3 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Chchd5Q9CQP3 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Chchd5Q9CQP3 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Chchd5Q9CQP3 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Chchd5Q9CQP3 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Chchd5Q9CQP3 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Chchd5Q9CQP3 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Chchd5Q9CQP3 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Chchd5Q9CQP3 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Chchd5Q9CQP3 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Chchd5Q9CQP3 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Chchd5Q9CQP3 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Chchd5Q9CQP3 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Chchd5Q9CQP3 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Chchd5Q9CQP3 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Chchd5Q9CQP3 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Chchd5Q9CQP3 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Chchd5Q9CQP3 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Chchd5Q9CQP3 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Chchd5Q9CQP3 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Chchd5Q9CQP3 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Chchd5Q9CQP3 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Chchd5Q9CQP3 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Chchd5Q9CQP3 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Chchd5Q9CQP3 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Chchd5Q9CQP3 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Chchd5Q9CQP3 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Chchd5Q9CQP3 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Chchd5Q9CQP3 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Chchd5Q9CQP3 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Chchd5Q9CQP3 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Chchd5Q9CQP3 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Chchd5Q9CQP3 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Chchd5Q9CQP3 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Chchd5Q9CQP3 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Chchd5Q9CQP3 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Chchd5Q9CQP3 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Chchd5Q9CQP3 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Chchd5Q9CQP3 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Chchd5Q9CQP3 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Chchd5Q9CQP3 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Chchd5Q9CQP3 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Chchd5Q9CQP3 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Chchd5Q9CQP3 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Chchd5Q9CQP3 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Chchd5Q9CQP3 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Chchd5Q9CQP3 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Chchd5Q9CQP3 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Chchd5Q9CQP3 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Chchd5Q9CQP3 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Chchd5Q9CQP3 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Chchd5Q9CQP3 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Chchd5Q9CQP3 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Chchd5Q9CQP3 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Chchd5Q9CQP3 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Chchd5Q9CQP3 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Chchd5Q9CQP3 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Chchd5Q9CQP3 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Chchd5Q9CQP3 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Chchd5Q9CQP3 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Chchd5Q9CQP3 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Chchd5Q9CQP3 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Chchd5Q9CQP3 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Chchd5Q9CQP3 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Chchd5Q9CQP3 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Chchd5Q9CQP3 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Chchd5Q9CQP3 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Chchd5Q9CQP3 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Chchd5Q9CQP3 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Chchd5Q9CQP3 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Chchd5Q9CQP3 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Chchd5Q9CQP3 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Chchd5Q9CQP3 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Chchd5Q9CQP3 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Chchd5Q9CQP3 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
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