Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE1

Nipsnap3b, Protein NipSnap homolog 3B, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap3bQ9CQE1 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nipsnap3bQ9CQE1 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Nipsnap3bQ9CQE1 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nipsnap3bQ9CQE1 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nipsnap3bQ9CQE1 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Nipsnap3bQ9CQE1 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nipsnap3bQ9CQE1 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nipsnap3bQ9CQE1 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Nipsnap3bQ9CQE1 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nipsnap3bQ9CQE1 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nipsnap3bQ9CQE1 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nipsnap3bQ9CQE1 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nipsnap3bQ9CQE1 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nipsnap3bQ9CQE1 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nipsnap3bQ9CQE1 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nipsnap3bQ9CQE1 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nipsnap3bQ9CQE1 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Nipsnap3bQ9CQE1 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nipsnap3bQ9CQE1 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Nipsnap3bQ9CQE1 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nipsnap3bQ9CQE1 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nipsnap3bQ9CQE1 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nipsnap3bQ9CQE1 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nipsnap3bQ9CQE1 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nipsnap3bQ9CQE1 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nipsnap3bQ9CQE1 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nipsnap3bQ9CQE1 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nipsnap3bQ9CQE1 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nipsnap3bQ9CQE1 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nipsnap3bQ9CQE1 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nipsnap3bQ9CQE1 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nipsnap3bQ9CQE1 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nipsnap3bQ9CQE1 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nipsnap3bQ9CQE1 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Nipsnap3bQ9CQE1 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nipsnap3bQ9CQE1 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nipsnap3bQ9CQE1 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nipsnap3bQ9CQE1 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nipsnap3bQ9CQE1 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nipsnap3bQ9CQE1 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nipsnap3bQ9CQE1 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nipsnap3bQ9CQE1 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nipsnap3bQ9CQE1 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nipsnap3bQ9CQE1 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nipsnap3bQ9CQE1 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nipsnap3bQ9CQE1 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nipsnap3bQ9CQE1 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nipsnap3bQ9CQE1 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nipsnap3bQ9CQE1 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nipsnap3bQ9CQE1 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nipsnap3bQ9CQE1 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nipsnap3bQ9CQE1 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nipsnap3bQ9CQE1 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nipsnap3bQ9CQE1 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nipsnap3bQ9CQE1 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nipsnap3bQ9CQE1 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nipsnap3bQ9CQE1 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nipsnap3bQ9CQE1 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nipsnap3bQ9CQE1 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nipsnap3bQ9CQE1 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nipsnap3bQ9CQE1 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nipsnap3bQ9CQE1 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nipsnap3bQ9CQE1 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nipsnap3bQ9CQE1 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nipsnap3bQ9CQE1 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nipsnap3bQ9CQE1 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nipsnap3bQ9CQE1 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nipsnap3bQ9CQE1 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nipsnap3bQ9CQE1 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nipsnap3bQ9CQE1 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nipsnap3bQ9CQE1 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nipsnap3bQ9CQE1 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nipsnap3bQ9CQE1 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nipsnap3bQ9CQE1 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nipsnap3bQ9CQE1 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nipsnap3bQ9CQE1 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nipsnap3bQ9CQE1 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Nipsnap3bQ9CQE1 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nipsnap3bQ9CQE1 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nipsnap3bQ9CQE1 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nipsnap3bQ9CQE1 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nipsnap3bQ9CQE1 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nipsnap3bQ9CQE1 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nipsnap3bQ9CQE1 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Nipsnap3bQ9CQE1 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nipsnap3bQ9CQE1 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nipsnap3bQ9CQE1 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nipsnap3bQ9CQE1 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nipsnap3bQ9CQE1 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nipsnap3bQ9CQE1 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nipsnap3bQ9CQE1 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nipsnap3bQ9CQE1 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms