Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD0

Rpl39l, RIKEN cDNA 4930517K11, mousemouse

Predictions only

Length 51 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl39lQ9CQD0 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rpl39lQ9CQD0 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rpl39lQ9CQD0 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rpl39lQ9CQD0 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Rpl39lQ9CQD0 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rpl39lQ9CQD0 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rpl39lQ9CQD0 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rpl39lQ9CQD0 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.63
Rpl39lQ9CQD0 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
Rpl39lQ9CQD0 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
Rpl39lQ9CQD0 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rpl39lQ9CQD0 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rpl39lQ9CQD0 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rpl39lQ9CQD0 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rpl39lQ9CQD0 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rpl39lQ9CQD0 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rpl39lQ9CQD0 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rpl39lQ9CQD0 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rpl39lQ9CQD0 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rpl39lQ9CQD0 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rpl39lQ9CQD0 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rpl39lQ9CQD0 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rpl39lQ9CQD0 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rpl39lQ9CQD0 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rpl39lQ9CQD0 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rpl39lQ9CQD0 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rpl39lQ9CQD0 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rpl39lQ9CQD0 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rpl39lQ9CQD0 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rpl39lQ9CQD0 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rpl39lQ9CQD0 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rpl39lQ9CQD0 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rpl39lQ9CQD0 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rpl39lQ9CQD0 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rpl39lQ9CQD0 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rpl39lQ9CQD0 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rpl39lQ9CQD0 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rpl39lQ9CQD0 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rpl39lQ9CQD0 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpl39lQ9CQD0 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpl39lQ9CQD0 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpl39lQ9CQD0 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpl39lQ9CQD0 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpl39lQ9CQD0 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpl39lQ9CQD0 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpl39lQ9CQD0 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpl39lQ9CQD0 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpl39lQ9CQD0 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpl39lQ9CQD0 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpl39lQ9CQD0 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpl39lQ9CQD0 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpl39lQ9CQD0 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpl39lQ9CQD0 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpl39lQ9CQD0 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpl39lQ9CQD0 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpl39lQ9CQD0 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpl39lQ9CQD0 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpl39lQ9CQD0 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpl39lQ9CQD0 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpl39lQ9CQD0 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpl39lQ9CQD0 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpl39lQ9CQD0 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpl39lQ9CQD0 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpl39lQ9CQD0 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpl39lQ9CQD0 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpl39lQ9CQD0 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpl39lQ9CQD0 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpl39lQ9CQD0 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpl39lQ9CQD0 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpl39lQ9CQD0 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpl39lQ9CQD0 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpl39lQ9CQD0 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpl39lQ9CQD0 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpl39lQ9CQD0 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpl39lQ9CQD0 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpl39lQ9CQD0 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpl39lQ9CQD0 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpl39lQ9CQD0 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpl39lQ9CQD0 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpl39lQ9CQD0 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpl39lQ9CQD0 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpl39lQ9CQD0 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpl39lQ9CQD0 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpl39lQ9CQD0 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpl39lQ9CQD0 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpl39lQ9CQD0 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpl39lQ9CQD0 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpl39lQ9CQD0 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpl39lQ9CQD0 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpl39lQ9CQD0 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpl39lQ9CQD0 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpl39lQ9CQD0 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpl39lQ9CQD0 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpl39lQ9CQD0 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpl39lQ9CQD0 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpl39lQ9CQD0 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpl39lQ9CQD0 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpl39lQ9CQD0 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpl39lQ9CQD0 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpl39lQ9CQD0 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms