Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ84

Ubl4b, Ubiquitin-like protein 4B, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubl4bQ9CQ84 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ubl4bQ9CQ84 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ubl4bQ9CQ84 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ubl4bQ9CQ84 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ubl4bQ9CQ84 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ubl4bQ9CQ84 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ubl4bQ9CQ84 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ubl4bQ9CQ84 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Ubl4bQ9CQ84 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ubl4bQ9CQ84 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Ubl4bQ9CQ84 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ubl4bQ9CQ84 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ubl4bQ9CQ84 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ubl4bQ9CQ84 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ubl4bQ9CQ84 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ubl4bQ9CQ84 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ubl4bQ9CQ84 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ubl4bQ9CQ84 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ubl4bQ9CQ84 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Ubl4bQ9CQ84 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ubl4bQ9CQ84 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Ubl4bQ9CQ84 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ubl4bQ9CQ84 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ubl4bQ9CQ84 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ubl4bQ9CQ84 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ubl4bQ9CQ84 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ubl4bQ9CQ84 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ubl4bQ9CQ84 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ubl4bQ9CQ84 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ubl4bQ9CQ84 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Ubl4bQ9CQ84 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ubl4bQ9CQ84 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ubl4bQ9CQ84 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ubl4bQ9CQ84 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ubl4bQ9CQ84 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ubl4bQ9CQ84 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ubl4bQ9CQ84 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ubl4bQ9CQ84 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ubl4bQ9CQ84 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ubl4bQ9CQ84 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ubl4bQ9CQ84 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ubl4bQ9CQ84 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Ubl4bQ9CQ84 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ubl4bQ9CQ84 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ubl4bQ9CQ84 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ubl4bQ9CQ84 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ubl4bQ9CQ84 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ubl4bQ9CQ84 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ubl4bQ9CQ84 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Ubl4bQ9CQ84 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Ubl4bQ9CQ84 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Ubl4bQ9CQ84 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Ubl4bQ9CQ84 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
Ubl4bQ9CQ84 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
Ubl4bQ9CQ84 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Ubl4bQ9CQ84 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Ubl4bQ9CQ84 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Ubl4bQ9CQ84 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Ubl4bQ9CQ84 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Ubl4bQ9CQ84 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ubl4bQ9CQ84 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ubl4bQ9CQ84 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ubl4bQ9CQ84 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ubl4bQ9CQ84 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ubl4bQ9CQ84 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ubl4bQ9CQ84 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ubl4bQ9CQ84 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ubl4bQ9CQ84 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ubl4bQ9CQ84 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ubl4bQ9CQ84 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ubl4bQ9CQ84 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ubl4bQ9CQ84 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ubl4bQ9CQ84 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ubl4bQ9CQ84 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ubl4bQ9CQ84 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Ubl4bQ9CQ84 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ubl4bQ9CQ84 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ubl4bQ9CQ84 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ubl4bQ9CQ84 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ubl4bQ9CQ84 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ubl4bQ9CQ84 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ubl4bQ9CQ84 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ubl4bQ9CQ84 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ubl4bQ9CQ84 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ubl4bQ9CQ84 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ubl4bQ9CQ84 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ubl4bQ9CQ84 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ubl4bQ9CQ84 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ubl4bQ9CQ84 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ubl4bQ9CQ84 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ubl4bQ9CQ84 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ubl4bQ9CQ84 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ubl4bQ9CQ84 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ubl4bQ9CQ84 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Ubl4bQ9CQ84 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ubl4bQ9CQ84 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ubl4bQ9CQ84 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ubl4bQ9CQ84 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ubl4bQ9CQ84 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ubl4bQ9CQ84 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms