Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ73

Pkp2, Plakophilin 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp2Q9CQ73 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pkp2Q9CQ73 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pkp2Q9CQ73 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pkp2Q9CQ73 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pkp2Q9CQ73 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pkp2Q9CQ73 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pkp2Q9CQ73 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pkp2Q9CQ73 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pkp2Q9CQ73 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pkp2Q9CQ73 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pkp2Q9CQ73 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pkp2Q9CQ73 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pkp2Q9CQ73 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pkp2Q9CQ73 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pkp2Q9CQ73 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pkp2Q9CQ73 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Pkp2Q9CQ73 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pkp2Q9CQ73 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pkp2Q9CQ73 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pkp2Q9CQ73 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pkp2Q9CQ73 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pkp2Q9CQ73 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pkp2Q9CQ73 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pkp2Q9CQ73 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pkp2Q9CQ73 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pkp2Q9CQ73 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pkp2Q9CQ73 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Pkp2Q9CQ73 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pkp2Q9CQ73 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pkp2Q9CQ73 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pkp2Q9CQ73 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pkp2Q9CQ73 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pkp2Q9CQ73 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pkp2Q9CQ73 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pkp2Q9CQ73 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pkp2Q9CQ73 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pkp2Q9CQ73 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pkp2Q9CQ73 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Pkp2Q9CQ73 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Pkp2Q9CQ73 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Pkp2Q9CQ73 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Pkp2Q9CQ73 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pkp2Q9CQ73 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pkp2Q9CQ73 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pkp2Q9CQ73 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pkp2Q9CQ73 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pkp2Q9CQ73 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pkp2Q9CQ73 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pkp2Q9CQ73 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pkp2Q9CQ73 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pkp2Q9CQ73 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Pkp2Q9CQ73 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pkp2Q9CQ73 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pkp2Q9CQ73 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pkp2Q9CQ73 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pkp2Q9CQ73 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pkp2Q9CQ73 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pkp2Q9CQ73 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pkp2Q9CQ73 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pkp2Q9CQ73 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pkp2Q9CQ73 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pkp2Q9CQ73 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pkp2Q9CQ73 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pkp2Q9CQ73 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pkp2Q9CQ73 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pkp2Q9CQ73 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pkp2Q9CQ73 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pkp2Q9CQ73 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pkp2Q9CQ73 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pkp2Q9CQ73 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Pkp2Q9CQ73 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pkp2Q9CQ73 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pkp2Q9CQ73 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pkp2Q9CQ73 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pkp2Q9CQ73 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pkp2Q9CQ73 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pkp2Q9CQ73 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pkp2Q9CQ73 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pkp2Q9CQ73 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pkp2Q9CQ73 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pkp2Q9CQ73 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pkp2Q9CQ73 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pkp2Q9CQ73 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pkp2Q9CQ73 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pkp2Q9CQ73 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pkp2Q9CQ73 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pkp2Q9CQ73 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Pkp2Q9CQ73 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Pkp2Q9CQ73 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Pkp2Q9CQ73 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pkp2Q9CQ73 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Pkp2Q9CQ73 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Pkp2Q9CQ73 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pkp2Q9CQ73 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pkp2Q9CQ73 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pkp2Q9CQ73 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pkp2Q9CQ73 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pkp2Q9CQ73 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pkp2Q9CQ73 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pkp2Q9CQ73 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms