Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Atg3Q9CPX6 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Atg3Q9CPX6 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Atg3Q9CPX6 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atg3Q9CPX6 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Atg3Q9CPX6 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atg3Q9CPX6 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atg3Q9CPX6 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atg3Q9CPX6 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atg3Q9CPX6 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Atg3Q9CPX6 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atg3Q9CPX6 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atg3Q9CPX6 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atg3Q9CPX6 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atg3Q9CPX6 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atg3Q9CPX6 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atg3Q9CPX6 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atg3Q9CPX6 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atg3Q9CPX6 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atg3Q9CPX6 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atg3Q9CPX6 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atg3Q9CPX6 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atg3Q9CPX6 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atg3Q9CPX6 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atg3Q9CPX6 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Atg3Q9CPX6 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atg3Q9CPX6 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atg3Q9CPX6 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atg3Q9CPX6 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atg3Q9CPX6 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atg3Q9CPX6 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atg3Q9CPX6 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atg3Q9CPX6 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atg3Q9CPX6 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atg3Q9CPX6 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atg3Q9CPX6 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atg3Q9CPX6 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atg3Q9CPX6 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atg3Q9CPX6 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atg3Q9CPX6 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atg3Q9CPX6 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Atg3Q9CPX6 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atg3Q9CPX6 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atg3Q9CPX6 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Atg3Q9CPX6 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atg3Q9CPX6 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Atg3Q9CPX6 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atg3Q9CPX6 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atg3Q9CPX6 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atg3Q9CPX6 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atg3Q9CPX6 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atg3Q9CPX6 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atg3Q9CPX6 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atg3Q9CPX6 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atg3Q9CPX6 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atg3Q9CPX6 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atg3Q9CPX6 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atg3Q9CPX6 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atg3Q9CPX6 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atg3Q9CPX6 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atg3Q9CPX6 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Atg3Q9CPX6 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atg3Q9CPX6 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atg3Q9CPX6 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Atg3Q9CPX6 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atg3Q9CPX6 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atg3Q9CPX6 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Atg3Q9CPX6 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atg3Q9CPX6 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atg3Q9CPX6 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atg3Q9CPX6 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atg3Q9CPX6 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atg3Q9CPX6 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atg3Q9CPX6 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atg3Q9CPX6 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atg3Q9CPX6 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atg3Q9CPX6 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atg3Q9CPX6 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atg3Q9CPX6 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atg3Q9CPX6 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atg3Q9CPX6 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atg3Q9CPX6 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atg3Q9CPX6 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atg3Q9CPX6 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atg3Q9CPX6 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atg3Q9CPX6 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atg3Q9CPX6 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Atg3Q9CPX6 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Atg3Q9CPX6 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Atg3Q9CPX6 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Atg3Q9CPX6 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Atg3Q9CPX6 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Atg3Q9CPX6 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Atg3Q9CPX6 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Atg3Q9CPX6 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Atg3Q9CPX6 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Atg3Q9CPX6 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Atg3Q9CPX6 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Atg3Q9CPX6 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Atg3Q9CPX6 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms