Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR4

Rpl17, 60S ribosomal protein L17, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 184 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl17Q9CPR4 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rpl17Q9CPR4 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rpl17Q9CPR4 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rpl17Q9CPR4 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rpl17Q9CPR4 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rpl17Q9CPR4 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rpl17Q9CPR4 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rpl17Q9CPR4 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Rpl17Q9CPR4 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rpl17Q9CPR4 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rpl17Q9CPR4 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rpl17Q9CPR4 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rpl17Q9CPR4 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rpl17Q9CPR4 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rpl17Q9CPR4 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rpl17Q9CPR4 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rpl17Q9CPR4 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rpl17Q9CPR4 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rpl17Q9CPR4 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rpl17Q9CPR4 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rpl17Q9CPR4 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rpl17Q9CPR4 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rpl17Q9CPR4 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rpl17Q9CPR4 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rpl17Q9CPR4 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rpl17Q9CPR4 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rpl17Q9CPR4 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rpl17Q9CPR4 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rpl17Q9CPR4 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rpl17Q9CPR4 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rpl17Q9CPR4 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rpl17Q9CPR4 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rpl17Q9CPR4 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rpl17Q9CPR4 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rpl17Q9CPR4 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rpl17Q9CPR4 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rpl17Q9CPR4 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rpl17Q9CPR4 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rpl17Q9CPR4 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rpl17Q9CPR4 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rpl17Q9CPR4 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rpl17Q9CPR4 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rpl17Q9CPR4 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rpl17Q9CPR4 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rpl17Q9CPR4 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rpl17Q9CPR4 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rpl17Q9CPR4 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Rpl17Q9CPR4 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rpl17Q9CPR4 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rpl17Q9CPR4 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rpl17Q9CPR4 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rpl17Q9CPR4 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rpl17Q9CPR4 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rpl17Q9CPR4 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rpl17Q9CPR4 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rpl17Q9CPR4 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rpl17Q9CPR4 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rpl17Q9CPR4 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rpl17Q9CPR4 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rpl17Q9CPR4 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rpl17Q9CPR4 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rpl17Q9CPR4 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rpl17Q9CPR4 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rpl17Q9CPR4 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rpl17Q9CPR4 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rpl17Q9CPR4 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rpl17Q9CPR4 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rpl17Q9CPR4 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rpl17Q9CPR4 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rpl17Q9CPR4 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rpl17Q9CPR4 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rpl17Q9CPR4 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rpl17Q9CPR4 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rpl17Q9CPR4 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rpl17Q9CPR4 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rpl17Q9CPR4 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rpl17Q9CPR4 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rpl17Q9CPR4 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rpl17Q9CPR4 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rpl17Q9CPR4 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rpl17Q9CPR4 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rpl17Q9CPR4 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rpl17Q9CPR4 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rpl17Q9CPR4 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Rpl17Q9CPR4 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rpl17Q9CPR4 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rpl17Q9CPR4 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Rpl17Q9CPR4 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Rpl17Q9CPR4 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rpl17Q9CPR4 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rpl17Q9CPR4 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rpl17Q9CPR4 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rpl17Q9CPR4 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rpl17Q9CPR4 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rpl17Q9CPR4 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rpl17Q9CPR4 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rpl17Q9CPR4 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rpl17Q9CPR4 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rpl17Q9CPR4 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rpl17Q9CPR4 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms