Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV5

Bhlhe41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe41Q99PV5 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Bhlhe41Q99PV5 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bhlhe41Q99PV5 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bhlhe41Q99PV5 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bhlhe41Q99PV5 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bhlhe41Q99PV5 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bhlhe41Q99PV5 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bhlhe41Q99PV5 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Bhlhe41Q99PV5 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bhlhe41Q99PV5 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bhlhe41Q99PV5 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bhlhe41Q99PV5 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bhlhe41Q99PV5 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bhlhe41Q99PV5 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bhlhe41Q99PV5 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bhlhe41Q99PV5 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bhlhe41Q99PV5 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bhlhe41Q99PV5 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bhlhe41Q99PV5 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bhlhe41Q99PV5 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bhlhe41Q99PV5 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bhlhe41Q99PV5 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bhlhe41Q99PV5 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bhlhe41Q99PV5 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bhlhe41Q99PV5 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Bhlhe41Q99PV5 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bhlhe41Q99PV5 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bhlhe41Q99PV5 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bhlhe41Q99PV5 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bhlhe41Q99PV5 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bhlhe41Q99PV5 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bhlhe41Q99PV5 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bhlhe41Q99PV5 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bhlhe41Q99PV5 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bhlhe41Q99PV5 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bhlhe41Q99PV5 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bhlhe41Q99PV5 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bhlhe41Q99PV5 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bhlhe41Q99PV5 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bhlhe41Q99PV5 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bhlhe41Q99PV5 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bhlhe41Q99PV5 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bhlhe41Q99PV5 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bhlhe41Q99PV5 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bhlhe41Q99PV5 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bhlhe41Q99PV5 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bhlhe41Q99PV5 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bhlhe41Q99PV5 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bhlhe41Q99PV5 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bhlhe41Q99PV5 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bhlhe41Q99PV5 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bhlhe41Q99PV5 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bhlhe41Q99PV5 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bhlhe41Q99PV5 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bhlhe41Q99PV5 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bhlhe41Q99PV5 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bhlhe41Q99PV5 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bhlhe41Q99PV5 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Bhlhe41Q99PV5 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bhlhe41Q99PV5 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bhlhe41Q99PV5 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Bhlhe41Q99PV5 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bhlhe41Q99PV5 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bhlhe41Q99PV5 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bhlhe41Q99PV5 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bhlhe41Q99PV5 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bhlhe41Q99PV5 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Bhlhe41Q99PV5 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bhlhe41Q99PV5 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bhlhe41Q99PV5 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bhlhe41Q99PV5 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bhlhe41Q99PV5 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Bhlhe41Q99PV5 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bhlhe41Q99PV5 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bhlhe41Q99PV5 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bhlhe41Q99PV5 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bhlhe41Q99PV5 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bhlhe41Q99PV5 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bhlhe41Q99PV5 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bhlhe41Q99PV5 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bhlhe41Q99PV5 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bhlhe41Q99PV5 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bhlhe41Q99PV5 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bhlhe41Q99PV5 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bhlhe41Q99PV5 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bhlhe41Q99PV5 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bhlhe41Q99PV5 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bhlhe41Q99PV5 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bhlhe41Q99PV5 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bhlhe41Q99PV5 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bhlhe41Q99PV5 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bhlhe41Q99PV5 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bhlhe41Q99PV5 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bhlhe41Q99PV5 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Bhlhe41Q99PV5 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bhlhe41Q99PV5 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bhlhe41Q99PV5 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bhlhe41Q99PV5 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bhlhe41Q99PV5 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bhlhe41Q99PV5 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms