Protein–RNA interactions for Protein: Q99PJ2

Trim8, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIM8, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim8Q99PJ2 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim8Q99PJ2 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim8Q99PJ2 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim8Q99PJ2 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim8Q99PJ2 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim8Q99PJ2 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim8Q99PJ2 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim8Q99PJ2 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim8Q99PJ2 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim8Q99PJ2 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim8Q99PJ2 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim8Q99PJ2 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim8Q99PJ2 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim8Q99PJ2 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim8Q99PJ2 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim8Q99PJ2 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim8Q99PJ2 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim8Q99PJ2 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim8Q99PJ2 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim8Q99PJ2 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim8Q99PJ2 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim8Q99PJ2 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim8Q99PJ2 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim8Q99PJ2 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim8Q99PJ2 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim8Q99PJ2 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim8Q99PJ2 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim8Q99PJ2 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim8Q99PJ2 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim8Q99PJ2 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim8Q99PJ2 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim8Q99PJ2 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim8Q99PJ2 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim8Q99PJ2 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim8Q99PJ2 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim8Q99PJ2 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim8Q99PJ2 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim8Q99PJ2 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim8Q99PJ2 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim8Q99PJ2 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim8Q99PJ2 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim8Q99PJ2 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim8Q99PJ2 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim8Q99PJ2 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim8Q99PJ2 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Trim8Q99PJ2 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Trim8Q99PJ2 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Trim8Q99PJ2 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Trim8Q99PJ2 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Trim8Q99PJ2 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Trim8Q99PJ2 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Trim8Q99PJ2 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim8Q99PJ2 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim8Q99PJ2 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim8Q99PJ2 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim8Q99PJ2 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim8Q99PJ2 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim8Q99PJ2 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim8Q99PJ2 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim8Q99PJ2 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim8Q99PJ2 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim8Q99PJ2 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim8Q99PJ2 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim8Q99PJ2 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim8Q99PJ2 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim8Q99PJ2 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim8Q99PJ2 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim8Q99PJ2 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim8Q99PJ2 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim8Q99PJ2 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim8Q99PJ2 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim8Q99PJ2 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim8Q99PJ2 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim8Q99PJ2 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim8Q99PJ2 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim8Q99PJ2 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim8Q99PJ2 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim8Q99PJ2 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim8Q99PJ2 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim8Q99PJ2 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim8Q99PJ2 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim8Q99PJ2 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim8Q99PJ2 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim8Q99PJ2 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim8Q99PJ2 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim8Q99PJ2 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim8Q99PJ2 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim8Q99PJ2 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim8Q99PJ2 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim8Q99PJ2 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim8Q99PJ2 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim8Q99PJ2 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim8Q99PJ2 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim8Q99PJ2 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim8Q99PJ2 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim8Q99PJ2 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim8Q99PJ2 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim8Q99PJ2 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim8Q99PJ2 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim8Q99PJ2 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms