Protein–RNA interactions for Protein: Q99P88

Nup155, Nuclear pore complex protein Nup155, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup155Q99P88 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nup155Q99P88 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nup155Q99P88 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nup155Q99P88 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nup155Q99P88 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nup155Q99P88 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nup155Q99P88 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Nup155Q99P88 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Nup155Q99P88 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nup155Q99P88 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nup155Q99P88 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nup155Q99P88 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nup155Q99P88 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nup155Q99P88 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nup155Q99P88 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nup155Q99P88 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nup155Q99P88 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nup155Q99P88 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nup155Q99P88 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nup155Q99P88 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nup155Q99P88 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nup155Q99P88 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nup155Q99P88 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nup155Q99P88 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nup155Q99P88 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nup155Q99P88 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nup155Q99P88 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nup155Q99P88 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nup155Q99P88 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nup155Q99P88 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nup155Q99P88 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nup155Q99P88 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nup155Q99P88 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nup155Q99P88 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Nup155Q99P88 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nup155Q99P88 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nup155Q99P88 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nup155Q99P88 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Nup155Q99P88 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nup155Q99P88 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nup155Q99P88 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nup155Q99P88 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nup155Q99P88 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nup155Q99P88 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nup155Q99P88 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nup155Q99P88 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nup155Q99P88 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nup155Q99P88 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nup155Q99P88 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nup155Q99P88 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nup155Q99P88 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nup155Q99P88 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nup155Q99P88 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nup155Q99P88 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Nup155Q99P88 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Nup155Q99P88 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Nup155Q99P88 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Nup155Q99P88 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Nup155Q99P88 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Nup155Q99P88 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Nup155Q99P88 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Nup155Q99P88 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Nup155Q99P88 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Nup155Q99P88 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Nup155Q99P88 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Nup155Q99P88 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Nup155Q99P88 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Nup155Q99P88 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nup155Q99P88 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nup155Q99P88 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nup155Q99P88 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nup155Q99P88 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Nup155Q99P88 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nup155Q99P88 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nup155Q99P88 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nup155Q99P88 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nup155Q99P88 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nup155Q99P88 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nup155Q99P88 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nup155Q99P88 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nup155Q99P88 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nup155Q99P88 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nup155Q99P88 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nup155Q99P88 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nup155Q99P88 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nup155Q99P88 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nup155Q99P88 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nup155Q99P88 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nup155Q99P88 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Nup155Q99P88 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nup155Q99P88 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nup155Q99P88 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nup155Q99P88 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nup155Q99P88 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nup155Q99P88 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nup155Q99P88 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nup155Q99P88 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nup155Q99P88 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Nup155Q99P88 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Nup155Q99P88 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms