Protein–RNA interactions for Protein: Q99NH8

Trem2, Triggering receptor expressed on myeloid cells 2, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trem2Q99NH8 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trem2Q99NH8 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trem2Q99NH8 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trem2Q99NH8 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trem2Q99NH8 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trem2Q99NH8 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trem2Q99NH8 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Trem2Q99NH8 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trem2Q99NH8 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trem2Q99NH8 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trem2Q99NH8 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trem2Q99NH8 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trem2Q99NH8 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trem2Q99NH8 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trem2Q99NH8 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trem2Q99NH8 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trem2Q99NH8 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trem2Q99NH8 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trem2Q99NH8 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trem2Q99NH8 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trem2Q99NH8 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trem2Q99NH8 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trem2Q99NH8 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trem2Q99NH8 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Trem2Q99NH8 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trem2Q99NH8 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trem2Q99NH8 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trem2Q99NH8 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trem2Q99NH8 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trem2Q99NH8 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trem2Q99NH8 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Trem2Q99NH8 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trem2Q99NH8 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trem2Q99NH8 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trem2Q99NH8 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trem2Q99NH8 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Trem2Q99NH8 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trem2Q99NH8 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trem2Q99NH8 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trem2Q99NH8 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trem2Q99NH8 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trem2Q99NH8 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trem2Q99NH8 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trem2Q99NH8 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trem2Q99NH8 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trem2Q99NH8 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trem2Q99NH8 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trem2Q99NH8 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trem2Q99NH8 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trem2Q99NH8 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trem2Q99NH8 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trem2Q99NH8 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trem2Q99NH8 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trem2Q99NH8 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trem2Q99NH8 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trem2Q99NH8 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trem2Q99NH8 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trem2Q99NH8 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trem2Q99NH8 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trem2Q99NH8 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trem2Q99NH8 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trem2Q99NH8 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trem2Q99NH8 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Trem2Q99NH8 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trem2Q99NH8 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trem2Q99NH8 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trem2Q99NH8 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trem2Q99NH8 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trem2Q99NH8 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trem2Q99NH8 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trem2Q99NH8 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trem2Q99NH8 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trem2Q99NH8 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trem2Q99NH8 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trem2Q99NH8 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trem2Q99NH8 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trem2Q99NH8 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trem2Q99NH8 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trem2Q99NH8 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trem2Q99NH8 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trem2Q99NH8 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trem2Q99NH8 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trem2Q99NH8 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trem2Q99NH8 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trem2Q99NH8 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trem2Q99NH8 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trem2Q99NH8 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trem2Q99NH8 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Trem2Q99NH8 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trem2Q99NH8 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trem2Q99NH8 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trem2Q99NH8 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trem2Q99NH8 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trem2Q99NH8 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trem2Q99NH8 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trem2Q99NH8 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trem2Q99NH8 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trem2Q99NH8 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trem2Q99NH8 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trem2Q99NH8 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms