Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF3

Cep41, Centrosomal protein of 41 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep41Q99NF3 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cep41Q99NF3 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cep41Q99NF3 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cep41Q99NF3 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cep41Q99NF3 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cep41Q99NF3 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cep41Q99NF3 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cep41Q99NF3 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cep41Q99NF3 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cep41Q99NF3 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cep41Q99NF3 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cep41Q99NF3 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cep41Q99NF3 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cep41Q99NF3 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cep41Q99NF3 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cep41Q99NF3 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cep41Q99NF3 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cep41Q99NF3 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cep41Q99NF3 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cep41Q99NF3 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cep41Q99NF3 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cep41Q99NF3 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cep41Q99NF3 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cep41Q99NF3 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cep41Q99NF3 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cep41Q99NF3 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cep41Q99NF3 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cep41Q99NF3 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Cep41Q99NF3 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cep41Q99NF3 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cep41Q99NF3 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cep41Q99NF3 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cep41Q99NF3 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cep41Q99NF3 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cep41Q99NF3 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cep41Q99NF3 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cep41Q99NF3 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cep41Q99NF3 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cep41Q99NF3 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cep41Q99NF3 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cep41Q99NF3 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cep41Q99NF3 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Cep41Q99NF3 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cep41Q99NF3 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cep41Q99NF3 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cep41Q99NF3 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cep41Q99NF3 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cep41Q99NF3 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cep41Q99NF3 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cep41Q99NF3 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cep41Q99NF3 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cep41Q99NF3 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cep41Q99NF3 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cep41Q99NF3 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cep41Q99NF3 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Cep41Q99NF3 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cep41Q99NF3 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cep41Q99NF3 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cep41Q99NF3 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cep41Q99NF3 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cep41Q99NF3 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cep41Q99NF3 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cep41Q99NF3 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cep41Q99NF3 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cep41Q99NF3 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cep41Q99NF3 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cep41Q99NF3 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cep41Q99NF3 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cep41Q99NF3 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cep41Q99NF3 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cep41Q99NF3 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cep41Q99NF3 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cep41Q99NF3 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cep41Q99NF3 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cep41Q99NF3 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cep41Q99NF3 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Cep41Q99NF3 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cep41Q99NF3 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cep41Q99NF3 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cep41Q99NF3 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cep41Q99NF3 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cep41Q99NF3 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cep41Q99NF3 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cep41Q99NF3 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cep41Q99NF3 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cep41Q99NF3 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cep41Q99NF3 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cep41Q99NF3 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cep41Q99NF3 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cep41Q99NF3 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cep41Q99NF3 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cep41Q99NF3 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cep41Q99NF3 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cep41Q99NF3 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cep41Q99NF3 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cep41Q99NF3 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cep41Q99NF3 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cep41Q99NF3 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cep41Q99NF3 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cep41Q99NF3 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms