Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF2

Nsmf, NMDA receptor synaptonuclear signaling and neuronal migration factor, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NsmfQ99NF2 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NsmfQ99NF2 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NsmfQ99NF2 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NsmfQ99NF2 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NsmfQ99NF2 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NsmfQ99NF2 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NsmfQ99NF2 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NsmfQ99NF2 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NsmfQ99NF2 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NsmfQ99NF2 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NsmfQ99NF2 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NsmfQ99NF2 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
NsmfQ99NF2 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NsmfQ99NF2 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NsmfQ99NF2 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NsmfQ99NF2 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NsmfQ99NF2 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NsmfQ99NF2 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NsmfQ99NF2 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NsmfQ99NF2 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NsmfQ99NF2 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NsmfQ99NF2 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
NsmfQ99NF2 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NsmfQ99NF2 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NsmfQ99NF2 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NsmfQ99NF2 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NsmfQ99NF2 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NsmfQ99NF2 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NsmfQ99NF2 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NsmfQ99NF2 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NsmfQ99NF2 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
NsmfQ99NF2 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
NsmfQ99NF2 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NsmfQ99NF2 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NsmfQ99NF2 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NsmfQ99NF2 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NsmfQ99NF2 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
NsmfQ99NF2 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NsmfQ99NF2 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NsmfQ99NF2 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NsmfQ99NF2 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NsmfQ99NF2 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NsmfQ99NF2 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NsmfQ99NF2 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NsmfQ99NF2 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NsmfQ99NF2 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NsmfQ99NF2 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NsmfQ99NF2 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NsmfQ99NF2 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NsmfQ99NF2 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NsmfQ99NF2 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NsmfQ99NF2 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NsmfQ99NF2 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NsmfQ99NF2 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NsmfQ99NF2 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NsmfQ99NF2 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NsmfQ99NF2 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NsmfQ99NF2 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
NsmfQ99NF2 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NsmfQ99NF2 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NsmfQ99NF2 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NsmfQ99NF2 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NsmfQ99NF2 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NsmfQ99NF2 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NsmfQ99NF2 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NsmfQ99NF2 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NsmfQ99NF2 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NsmfQ99NF2 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NsmfQ99NF2 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NsmfQ99NF2 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NsmfQ99NF2 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NsmfQ99NF2 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NsmfQ99NF2 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NsmfQ99NF2 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NsmfQ99NF2 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NsmfQ99NF2 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NsmfQ99NF2 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NsmfQ99NF2 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NsmfQ99NF2 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NsmfQ99NF2 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NsmfQ99NF2 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NsmfQ99NF2 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NsmfQ99NF2 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NsmfQ99NF2 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NsmfQ99NF2 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NsmfQ99NF2 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NsmfQ99NF2 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NsmfQ99NF2 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NsmfQ99NF2 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NsmfQ99NF2 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NsmfQ99NF2 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NsmfQ99NF2 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NsmfQ99NF2 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NsmfQ99NF2 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NsmfQ99NF2 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NsmfQ99NF2 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NsmfQ99NF2 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NsmfQ99NF2 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NsmfQ99NF2 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NsmfQ99NF2 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms