Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF1

Bco2, Beta,beta-carotene 9',10'-oxygenase, mousemouse

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Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bco2Q99NF1 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Bco2Q99NF1 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Bco2Q99NF1 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Bco2Q99NF1 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Bco2Q99NF1 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Bco2Q99NF1 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Bco2Q99NF1 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Bco2Q99NF1 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Bco2Q99NF1 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Bco2Q99NF1 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Bco2Q99NF1 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Bco2Q99NF1 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Bco2Q99NF1 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Bco2Q99NF1 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Bco2Q99NF1 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Bco2Q99NF1 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Bco2Q99NF1 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Bco2Q99NF1 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Bco2Q99NF1 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Bco2Q99NF1 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Bco2Q99NF1 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Bco2Q99NF1 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Bco2Q99NF1 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Bco2Q99NF1 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Bco2Q99NF1 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Bco2Q99NF1 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Bco2Q99NF1 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Bco2Q99NF1 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Bco2Q99NF1 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Bco2Q99NF1 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Bco2Q99NF1 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Bco2Q99NF1 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Bco2Q99NF1 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Bco2Q99NF1 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Bco2Q99NF1 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Bco2Q99NF1 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Bco2Q99NF1 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Bco2Q99NF1 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Bco2Q99NF1 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Bco2Q99NF1 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Bco2Q99NF1 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Bco2Q99NF1 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Bco2Q99NF1 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Bco2Q99NF1 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Bco2Q99NF1 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Bco2Q99NF1 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Bco2Q99NF1 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Bco2Q99NF1 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Bco2Q99NF1 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Bco2Q99NF1 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Bco2Q99NF1 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Bco2Q99NF1 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Bco2Q99NF1 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Bco2Q99NF1 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Bco2Q99NF1 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Bco2Q99NF1 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Bco2Q99NF1 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Bco2Q99NF1 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Bco2Q99NF1 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Bco2Q99NF1 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Bco2Q99NF1 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Bco2Q99NF1 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Bco2Q99NF1 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Bco2Q99NF1 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Bco2Q99NF1 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Bco2Q99NF1 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Bco2Q99NF1 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Bco2Q99NF1 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Bco2Q99NF1 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Bco2Q99NF1 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Bco2Q99NF1 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Bco2Q99NF1 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Bco2Q99NF1 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Bco2Q99NF1 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Bco2Q99NF1 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Bco2Q99NF1 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Bco2Q99NF1 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Bco2Q99NF1 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Bco2Q99NF1 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Bco2Q99NF1 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Bco2Q99NF1 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Bco2Q99NF1 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Bco2Q99NF1 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Bco2Q99NF1 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Bco2Q99NF1 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Bco2Q99NF1 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Bco2Q99NF1 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Bco2Q99NF1 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Bco2Q99NF1 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Bco2Q99NF1 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Bco2Q99NF1 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Bco2Q99NF1 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Bco2Q99NF1 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Bco2Q99NF1 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Bco2Q99NF1 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Bco2Q99NF1 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Bco2Q99NF1 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Bco2Q99NF1 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Bco2Q99NF1 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Bco2Q99NF1 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
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