Protein–RNA interactions for Protein: Q99NB8

Ubqln4, Ubiquilin-4, mousemouse

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Length 596 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubqln4Q99NB8 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubqln4Q99NB8 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubqln4Q99NB8 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubqln4Q99NB8 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubqln4Q99NB8 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubqln4Q99NB8 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubqln4Q99NB8 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubqln4Q99NB8 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubqln4Q99NB8 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubqln4Q99NB8 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubqln4Q99NB8 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubqln4Q99NB8 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubqln4Q99NB8 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubqln4Q99NB8 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubqln4Q99NB8 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubqln4Q99NB8 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ubqln4Q99NB8 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ubqln4Q99NB8 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ubqln4Q99NB8 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ubqln4Q99NB8 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ubqln4Q99NB8 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ubqln4Q99NB8 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ubqln4Q99NB8 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ubqln4Q99NB8 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ubqln4Q99NB8 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ubqln4Q99NB8 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ubqln4Q99NB8 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ubqln4Q99NB8 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ubqln4Q99NB8 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ubqln4Q99NB8 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ubqln4Q99NB8 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ubqln4Q99NB8 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ubqln4Q99NB8 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ubqln4Q99NB8 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ubqln4Q99NB8 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ubqln4Q99NB8 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ubqln4Q99NB8 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ubqln4Q99NB8 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ubqln4Q99NB8 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ubqln4Q99NB8 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ubqln4Q99NB8 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ubqln4Q99NB8 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ubqln4Q99NB8 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ubqln4Q99NB8 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Ubqln4Q99NB8 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ubqln4Q99NB8 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ubqln4Q99NB8 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ubqln4Q99NB8 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ubqln4Q99NB8 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ubqln4Q99NB8 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ubqln4Q99NB8 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ubqln4Q99NB8 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Ubqln4Q99NB8 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Ubqln4Q99NB8 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ubqln4Q99NB8 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ubqln4Q99NB8 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ubqln4Q99NB8 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ubqln4Q99NB8 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ubqln4Q99NB8 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ubqln4Q99NB8 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Ubqln4Q99NB8 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ubqln4Q99NB8 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ubqln4Q99NB8 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ubqln4Q99NB8 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ubqln4Q99NB8 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ubqln4Q99NB8 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ubqln4Q99NB8 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ubqln4Q99NB8 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ubqln4Q99NB8 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ubqln4Q99NB8 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ubqln4Q99NB8 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ubqln4Q99NB8 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ubqln4Q99NB8 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ubqln4Q99NB8 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ubqln4Q99NB8 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ubqln4Q99NB8 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ubqln4Q99NB8 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ubqln4Q99NB8 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ubqln4Q99NB8 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ubqln4Q99NB8 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ubqln4Q99NB8 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms