Protein–RNA interactions for Protein: Q99NA9

Pcgf6, Polycomb group RING finger protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcgf6Q99NA9 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pcgf6Q99NA9 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pcgf6Q99NA9 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pcgf6Q99NA9 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pcgf6Q99NA9 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pcgf6Q99NA9 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pcgf6Q99NA9 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pcgf6Q99NA9 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pcgf6Q99NA9 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pcgf6Q99NA9 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Pcgf6Q99NA9 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pcgf6Q99NA9 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pcgf6Q99NA9 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pcgf6Q99NA9 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pcgf6Q99NA9 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pcgf6Q99NA9 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pcgf6Q99NA9 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pcgf6Q99NA9 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pcgf6Q99NA9 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Pcgf6Q99NA9 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Pcgf6Q99NA9 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Pcgf6Q99NA9 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Pcgf6Q99NA9 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Pcgf6Q99NA9 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Pcgf6Q99NA9 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pcgf6Q99NA9 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pcgf6Q99NA9 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pcgf6Q99NA9 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pcgf6Q99NA9 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pcgf6Q99NA9 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pcgf6Q99NA9 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pcgf6Q99NA9 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pcgf6Q99NA9 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pcgf6Q99NA9 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pcgf6Q99NA9 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pcgf6Q99NA9 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pcgf6Q99NA9 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pcgf6Q99NA9 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pcgf6Q99NA9 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pcgf6Q99NA9 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pcgf6Q99NA9 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pcgf6Q99NA9 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pcgf6Q99NA9 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pcgf6Q99NA9 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pcgf6Q99NA9 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Pcgf6Q99NA9 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pcgf6Q99NA9 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pcgf6Q99NA9 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pcgf6Q99NA9 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pcgf6Q99NA9 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pcgf6Q99NA9 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pcgf6Q99NA9 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pcgf6Q99NA9 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pcgf6Q99NA9 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pcgf6Q99NA9 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pcgf6Q99NA9 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pcgf6Q99NA9 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pcgf6Q99NA9 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pcgf6Q99NA9 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pcgf6Q99NA9 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pcgf6Q99NA9 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pcgf6Q99NA9 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pcgf6Q99NA9 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pcgf6Q99NA9 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pcgf6Q99NA9 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pcgf6Q99NA9 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pcgf6Q99NA9 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pcgf6Q99NA9 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pcgf6Q99NA9 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pcgf6Q99NA9 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pcgf6Q99NA9 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pcgf6Q99NA9 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pcgf6Q99NA9 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pcgf6Q99NA9 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pcgf6Q99NA9 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pcgf6Q99NA9 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pcgf6Q99NA9 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pcgf6Q99NA9 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pcgf6Q99NA9 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pcgf6Q99NA9 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pcgf6Q99NA9 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pcgf6Q99NA9 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pcgf6Q99NA9 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pcgf6Q99NA9 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pcgf6Q99NA9 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pcgf6Q99NA9 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pcgf6Q99NA9 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pcgf6Q99NA9 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pcgf6Q99NA9 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pcgf6Q99NA9 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pcgf6Q99NA9 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pcgf6Q99NA9 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pcgf6Q99NA9 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pcgf6Q99NA9 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Pcgf6Q99NA9 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pcgf6Q99NA9 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pcgf6Q99NA9 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pcgf6Q99NA9 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pcgf6Q99NA9 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pcgf6Q99NA9 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms