Protein–RNA interactions for Protein: Q99N16

Cyp4f3, Leukotriene-B(4) omega-hydroxylase 2, mousemouse

Predictions only

Length 524 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp4f3Q99N16 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cyp4f3Q99N16 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cyp4f3Q99N16 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cyp4f3Q99N16 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cyp4f3Q99N16 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cyp4f3Q99N16 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cyp4f3Q99N16 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cyp4f3Q99N16 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cyp4f3Q99N16 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cyp4f3Q99N16 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cyp4f3Q99N16 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cyp4f3Q99N16 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cyp4f3Q99N16 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cyp4f3Q99N16 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cyp4f3Q99N16 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cyp4f3Q99N16 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cyp4f3Q99N16 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cyp4f3Q99N16 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cyp4f3Q99N16 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cyp4f3Q99N16 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cyp4f3Q99N16 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cyp4f3Q99N16 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cyp4f3Q99N16 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cyp4f3Q99N16 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cyp4f3Q99N16 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cyp4f3Q99N16 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cyp4f3Q99N16 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cyp4f3Q99N16 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cyp4f3Q99N16 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cyp4f3Q99N16 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cyp4f3Q99N16 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cyp4f3Q99N16 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cyp4f3Q99N16 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cyp4f3Q99N16 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cyp4f3Q99N16 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cyp4f3Q99N16 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cyp4f3Q99N16 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cyp4f3Q99N16 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cyp4f3Q99N16 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cyp4f3Q99N16 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cyp4f3Q99N16 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cyp4f3Q99N16 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cyp4f3Q99N16 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cyp4f3Q99N16 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cyp4f3Q99N16 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cyp4f3Q99N16 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cyp4f3Q99N16 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cyp4f3Q99N16 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cyp4f3Q99N16 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cyp4f3Q99N16 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cyp4f3Q99N16 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cyp4f3Q99N16 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cyp4f3Q99N16 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cyp4f3Q99N16 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cyp4f3Q99N16 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cyp4f3Q99N16 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cyp4f3Q99N16 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cyp4f3Q99N16 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cyp4f3Q99N16 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cyp4f3Q99N16 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cyp4f3Q99N16 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cyp4f3Q99N16 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cyp4f3Q99N16 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cyp4f3Q99N16 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cyp4f3Q99N16 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cyp4f3Q99N16 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cyp4f3Q99N16 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cyp4f3Q99N16 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cyp4f3Q99N16 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cyp4f3Q99N16 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cyp4f3Q99N16 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cyp4f3Q99N16 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cyp4f3Q99N16 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cyp4f3Q99N16 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cyp4f3Q99N16 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cyp4f3Q99N16 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cyp4f3Q99N16 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cyp4f3Q99N16 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cyp4f3Q99N16 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cyp4f3Q99N16 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cyp4f3Q99N16 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cyp4f3Q99N16 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cyp4f3Q99N16 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cyp4f3Q99N16 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cyp4f3Q99N16 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cyp4f3Q99N16 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cyp4f3Q99N16 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cyp4f3Q99N16 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cyp4f3Q99N16 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cyp4f3Q99N16 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cyp4f3Q99N16 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cyp4f3Q99N16 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cyp4f3Q99N16 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cyp4f3Q99N16 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cyp4f3Q99N16 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cyp4f3Q99N16 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cyp4f3Q99N16 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cyp4f3Q99N16 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cyp4f3Q99N16 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cyp4f3Q99N16 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms