Protein–RNA interactions for Protein: Q99MW3

Pramel1, Preferentially expressed antigen in melanoma-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramel1Q99MW3 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pramel1Q99MW3 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pramel1Q99MW3 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pramel1Q99MW3 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pramel1Q99MW3 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pramel1Q99MW3 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pramel1Q99MW3 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pramel1Q99MW3 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pramel1Q99MW3 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Pramel1Q99MW3 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pramel1Q99MW3 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Pramel1Q99MW3 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pramel1Q99MW3 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pramel1Q99MW3 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pramel1Q99MW3 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Pramel1Q99MW3 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pramel1Q99MW3 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pramel1Q99MW3 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pramel1Q99MW3 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pramel1Q99MW3 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pramel1Q99MW3 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pramel1Q99MW3 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pramel1Q99MW3 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pramel1Q99MW3 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pramel1Q99MW3 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pramel1Q99MW3 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Pramel1Q99MW3 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pramel1Q99MW3 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pramel1Q99MW3 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pramel1Q99MW3 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pramel1Q99MW3 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pramel1Q99MW3 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pramel1Q99MW3 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pramel1Q99MW3 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pramel1Q99MW3 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Pramel1Q99MW3 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pramel1Q99MW3 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pramel1Q99MW3 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pramel1Q99MW3 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pramel1Q99MW3 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pramel1Q99MW3 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pramel1Q99MW3 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pramel1Q99MW3 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pramel1Q99MW3 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pramel1Q99MW3 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pramel1Q99MW3 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pramel1Q99MW3 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Pramel1Q99MW3 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pramel1Q99MW3 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pramel1Q99MW3 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pramel1Q99MW3 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pramel1Q99MW3 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pramel1Q99MW3 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pramel1Q99MW3 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pramel1Q99MW3 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pramel1Q99MW3 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pramel1Q99MW3 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pramel1Q99MW3 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pramel1Q99MW3 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pramel1Q99MW3 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pramel1Q99MW3 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pramel1Q99MW3 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pramel1Q99MW3 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pramel1Q99MW3 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Pramel1Q99MW3 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pramel1Q99MW3 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Pramel1Q99MW3 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Pramel1Q99MW3 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pramel1Q99MW3 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pramel1Q99MW3 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pramel1Q99MW3 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pramel1Q99MW3 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pramel1Q99MW3 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pramel1Q99MW3 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pramel1Q99MW3 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pramel1Q99MW3 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pramel1Q99MW3 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pramel1Q99MW3 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pramel1Q99MW3 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pramel1Q99MW3 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pramel1Q99MW3 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pramel1Q99MW3 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pramel1Q99MW3 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pramel1Q99MW3 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pramel1Q99MW3 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pramel1Q99MW3 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pramel1Q99MW3 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pramel1Q99MW3 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pramel1Q99MW3 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pramel1Q99MW3 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pramel1Q99MW3 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pramel1Q99MW3 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pramel1Q99MW3 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pramel1Q99MW3 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pramel1Q99MW3 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pramel1Q99MW3 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pramel1Q99MW3 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pramel1Q99MW3 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pramel1Q99MW3 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pramel1Q99MW3 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms