Protein–RNA interactions for Protein: Q99MV1

Tdrd1, Tudor domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd1Q99MV1 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tdrd1Q99MV1 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tdrd1Q99MV1 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tdrd1Q99MV1 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tdrd1Q99MV1 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tdrd1Q99MV1 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Tdrd1Q99MV1 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tdrd1Q99MV1 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tdrd1Q99MV1 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tdrd1Q99MV1 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tdrd1Q99MV1 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tdrd1Q99MV1 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tdrd1Q99MV1 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tdrd1Q99MV1 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tdrd1Q99MV1 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tdrd1Q99MV1 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tdrd1Q99MV1 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tdrd1Q99MV1 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tdrd1Q99MV1 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tdrd1Q99MV1 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tdrd1Q99MV1 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tdrd1Q99MV1 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tdrd1Q99MV1 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tdrd1Q99MV1 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tdrd1Q99MV1 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tdrd1Q99MV1 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Tdrd1Q99MV1 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tdrd1Q99MV1 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tdrd1Q99MV1 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tdrd1Q99MV1 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tdrd1Q99MV1 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Tdrd1Q99MV1 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tdrd1Q99MV1 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tdrd1Q99MV1 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tdrd1Q99MV1 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Tdrd1Q99MV1 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tdrd1Q99MV1 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Tdrd1Q99MV1 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tdrd1Q99MV1 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tdrd1Q99MV1 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tdrd1Q99MV1 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tdrd1Q99MV1 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tdrd1Q99MV1 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tdrd1Q99MV1 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tdrd1Q99MV1 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tdrd1Q99MV1 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tdrd1Q99MV1 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tdrd1Q99MV1 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tdrd1Q99MV1 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tdrd1Q99MV1 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Tdrd1Q99MV1 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tdrd1Q99MV1 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tdrd1Q99MV1 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tdrd1Q99MV1 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tdrd1Q99MV1 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Tdrd1Q99MV1 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tdrd1Q99MV1 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Tdrd1Q99MV1 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Tdrd1Q99MV1 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tdrd1Q99MV1 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Tdrd1Q99MV1 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tdrd1Q99MV1 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tdrd1Q99MV1 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tdrd1Q99MV1 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tdrd1Q99MV1 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Tdrd1Q99MV1 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tdrd1Q99MV1 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tdrd1Q99MV1 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tdrd1Q99MV1 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tdrd1Q99MV1 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tdrd1Q99MV1 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tdrd1Q99MV1 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tdrd1Q99MV1 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Tdrd1Q99MV1 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tdrd1Q99MV1 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tdrd1Q99MV1 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tdrd1Q99MV1 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Tdrd1Q99MV1 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Tdrd1Q99MV1 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tdrd1Q99MV1 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tdrd1Q99MV1 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tdrd1Q99MV1 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tdrd1Q99MV1 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tdrd1Q99MV1 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tdrd1Q99MV1 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Tdrd1Q99MV1 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tdrd1Q99MV1 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tdrd1Q99MV1 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tdrd1Q99MV1 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tdrd1Q99MV1 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tdrd1Q99MV1 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tdrd1Q99MV1 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tdrd1Q99MV1 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tdrd1Q99MV1 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Tdrd1Q99MV1 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tdrd1Q99MV1 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tdrd1Q99MV1 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tdrd1Q99MV1 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tdrd1Q99MV1 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tdrd1Q99MV1 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms