Protein–RNA interactions for Protein: Q99MH5

Nme5, Nucleoside diphosphate kinase homolog 5, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme5Q99MH5 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nme5Q99MH5 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nme5Q99MH5 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nme5Q99MH5 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nme5Q99MH5 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nme5Q99MH5 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nme5Q99MH5 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nme5Q99MH5 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nme5Q99MH5 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nme5Q99MH5 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nme5Q99MH5 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nme5Q99MH5 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nme5Q99MH5 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nme5Q99MH5 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nme5Q99MH5 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nme5Q99MH5 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Nme5Q99MH5 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nme5Q99MH5 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nme5Q99MH5 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nme5Q99MH5 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nme5Q99MH5 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nme5Q99MH5 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nme5Q99MH5 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nme5Q99MH5 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nme5Q99MH5 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nme5Q99MH5 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nme5Q99MH5 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nme5Q99MH5 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nme5Q99MH5 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nme5Q99MH5 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nme5Q99MH5 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nme5Q99MH5 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nme5Q99MH5 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nme5Q99MH5 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nme5Q99MH5 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nme5Q99MH5 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Nme5Q99MH5 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nme5Q99MH5 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nme5Q99MH5 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nme5Q99MH5 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nme5Q99MH5 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nme5Q99MH5 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nme5Q99MH5 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nme5Q99MH5 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nme5Q99MH5 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nme5Q99MH5 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nme5Q99MH5 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nme5Q99MH5 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nme5Q99MH5 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nme5Q99MH5 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nme5Q99MH5 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nme5Q99MH5 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nme5Q99MH5 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nme5Q99MH5 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nme5Q99MH5 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nme5Q99MH5 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nme5Q99MH5 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nme5Q99MH5 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nme5Q99MH5 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nme5Q99MH5 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Nme5Q99MH5 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nme5Q99MH5 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nme5Q99MH5 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nme5Q99MH5 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nme5Q99MH5 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nme5Q99MH5 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nme5Q99MH5 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nme5Q99MH5 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nme5Q99MH5 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nme5Q99MH5 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nme5Q99MH5 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nme5Q99MH5 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nme5Q99MH5 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nme5Q99MH5 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nme5Q99MH5 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nme5Q99MH5 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nme5Q99MH5 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nme5Q99MH5 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nme5Q99MH5 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Nme5Q99MH5 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nme5Q99MH5 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nme5Q99MH5 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nme5Q99MH5 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nme5Q99MH5 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nme5Q99MH5 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nme5Q99MH5 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nme5Q99MH5 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nme5Q99MH5 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nme5Q99MH5 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nme5Q99MH5 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nme5Q99MH5 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nme5Q99MH5 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nme5Q99MH5 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nme5Q99MH5 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nme5Q99MH5 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nme5Q99MH5 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nme5Q99MH5 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Nme5Q99MH5 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Nme5Q99MH5 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Nme5Q99MH5 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms