Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

Predictions only

Length 1,454 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PtprtQ99M80 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PtprtQ99M80 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PtprtQ99M80 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PtprtQ99M80 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PtprtQ99M80 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PtprtQ99M80 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PtprtQ99M80 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
PtprtQ99M80 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
PtprtQ99M80 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PtprtQ99M80 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PtprtQ99M80 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
PtprtQ99M80 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PtprtQ99M80 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PtprtQ99M80 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PtprtQ99M80 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PtprtQ99M80 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PtprtQ99M80 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PtprtQ99M80 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PtprtQ99M80 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PtprtQ99M80 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PtprtQ99M80 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PtprtQ99M80 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PtprtQ99M80 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PtprtQ99M80 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PtprtQ99M80 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PtprtQ99M80 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PtprtQ99M80 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PtprtQ99M80 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PtprtQ99M80 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PtprtQ99M80 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PtprtQ99M80 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PtprtQ99M80 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PtprtQ99M80 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PtprtQ99M80 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
PtprtQ99M80 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PtprtQ99M80 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PtprtQ99M80 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PtprtQ99M80 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PtprtQ99M80 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PtprtQ99M80 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PtprtQ99M80 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PtprtQ99M80 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PtprtQ99M80 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PtprtQ99M80 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PtprtQ99M80 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PtprtQ99M80 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PtprtQ99M80 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PtprtQ99M80 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PtprtQ99M80 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PtprtQ99M80 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
PtprtQ99M80 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PtprtQ99M80 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PtprtQ99M80 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PtprtQ99M80 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PtprtQ99M80 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PtprtQ99M80 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PtprtQ99M80 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PtprtQ99M80 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PtprtQ99M80 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PtprtQ99M80 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PtprtQ99M80 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PtprtQ99M80 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PtprtQ99M80 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PtprtQ99M80 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PtprtQ99M80 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PtprtQ99M80 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PtprtQ99M80 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PtprtQ99M80 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PtprtQ99M80 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PtprtQ99M80 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PtprtQ99M80 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PtprtQ99M80 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
PtprtQ99M80 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PtprtQ99M80 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
PtprtQ99M80 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PtprtQ99M80 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PtprtQ99M80 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PtprtQ99M80 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PtprtQ99M80 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PtprtQ99M80 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PtprtQ99M80 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PtprtQ99M80 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PtprtQ99M80 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PtprtQ99M80 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PtprtQ99M80 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PtprtQ99M80 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PtprtQ99M80 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PtprtQ99M80 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PtprtQ99M80 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PtprtQ99M80 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PtprtQ99M80 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PtprtQ99M80 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PtprtQ99M80 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PtprtQ99M80 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PtprtQ99M80 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PtprtQ99M80 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PtprtQ99M80 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PtprtQ99M80 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PtprtQ99M80 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
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