Protein–RNA interactions for Protein: Q99LI7

Cstf3, Cleavage stimulation factor subunit 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cstf3Q99LI7 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cstf3Q99LI7 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cstf3Q99LI7 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cstf3Q99LI7 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cstf3Q99LI7 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cstf3Q99LI7 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Cstf3Q99LI7 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cstf3Q99LI7 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cstf3Q99LI7 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cstf3Q99LI7 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cstf3Q99LI7 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cstf3Q99LI7 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cstf3Q99LI7 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cstf3Q99LI7 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cstf3Q99LI7 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cstf3Q99LI7 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cstf3Q99LI7 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cstf3Q99LI7 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cstf3Q99LI7 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cstf3Q99LI7 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cstf3Q99LI7 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cstf3Q99LI7 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cstf3Q99LI7 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cstf3Q99LI7 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cstf3Q99LI7 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cstf3Q99LI7 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cstf3Q99LI7 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cstf3Q99LI7 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cstf3Q99LI7 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cstf3Q99LI7 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cstf3Q99LI7 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cstf3Q99LI7 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cstf3Q99LI7 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cstf3Q99LI7 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cstf3Q99LI7 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cstf3Q99LI7 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cstf3Q99LI7 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cstf3Q99LI7 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cstf3Q99LI7 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cstf3Q99LI7 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cstf3Q99LI7 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cstf3Q99LI7 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cstf3Q99LI7 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Cstf3Q99LI7 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cstf3Q99LI7 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cstf3Q99LI7 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cstf3Q99LI7 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cstf3Q99LI7 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cstf3Q99LI7 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cstf3Q99LI7 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cstf3Q99LI7 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cstf3Q99LI7 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cstf3Q99LI7 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cstf3Q99LI7 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cstf3Q99LI7 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cstf3Q99LI7 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cstf3Q99LI7 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cstf3Q99LI7 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cstf3Q99LI7 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cstf3Q99LI7 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cstf3Q99LI7 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cstf3Q99LI7 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cstf3Q99LI7 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cstf3Q99LI7 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cstf3Q99LI7 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cstf3Q99LI7 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cstf3Q99LI7 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cstf3Q99LI7 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cstf3Q99LI7 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cstf3Q99LI7 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cstf3Q99LI7 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cstf3Q99LI7 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cstf3Q99LI7 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cstf3Q99LI7 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cstf3Q99LI7 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cstf3Q99LI7 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cstf3Q99LI7 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cstf3Q99LI7 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cstf3Q99LI7 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Cstf3Q99LI7 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cstf3Q99LI7 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cstf3Q99LI7 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cstf3Q99LI7 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cstf3Q99LI7 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cstf3Q99LI7 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cstf3Q99LI7 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cstf3Q99LI7 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cstf3Q99LI7 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cstf3Q99LI7 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cstf3Q99LI7 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cstf3Q99LI7 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cstf3Q99LI7 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cstf3Q99LI7 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cstf3Q99LI7 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Cstf3Q99LI7 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cstf3Q99LI7 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cstf3Q99LI7 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cstf3Q99LI7 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cstf3Q99LI7 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cstf3Q99LI7 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms