Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG2

Tnpo2, Transportin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnpo2Q99LG2 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tnpo2Q99LG2 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tnpo2Q99LG2 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Tnpo2Q99LG2 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tnpo2Q99LG2 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Tnpo2Q99LG2 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tnpo2Q99LG2 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tnpo2Q99LG2 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tnpo2Q99LG2 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tnpo2Q99LG2 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tnpo2Q99LG2 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tnpo2Q99LG2 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tnpo2Q99LG2 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tnpo2Q99LG2 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tnpo2Q99LG2 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tnpo2Q99LG2 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tnpo2Q99LG2 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tnpo2Q99LG2 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tnpo2Q99LG2 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tnpo2Q99LG2 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tnpo2Q99LG2 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tnpo2Q99LG2 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tnpo2Q99LG2 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tnpo2Q99LG2 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tnpo2Q99LG2 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tnpo2Q99LG2 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tnpo2Q99LG2 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tnpo2Q99LG2 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tnpo2Q99LG2 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tnpo2Q99LG2 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tnpo2Q99LG2 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tnpo2Q99LG2 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tnpo2Q99LG2 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tnpo2Q99LG2 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tnpo2Q99LG2 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tnpo2Q99LG2 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tnpo2Q99LG2 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Tnpo2Q99LG2 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tnpo2Q99LG2 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tnpo2Q99LG2 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Tnpo2Q99LG2 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tnpo2Q99LG2 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tnpo2Q99LG2 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tnpo2Q99LG2 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tnpo2Q99LG2 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tnpo2Q99LG2 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tnpo2Q99LG2 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tnpo2Q99LG2 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tnpo2Q99LG2 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Tnpo2Q99LG2 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tnpo2Q99LG2 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tnpo2Q99LG2 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tnpo2Q99LG2 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tnpo2Q99LG2 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tnpo2Q99LG2 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Tnpo2Q99LG2 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tnpo2Q99LG2 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tnpo2Q99LG2 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tnpo2Q99LG2 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tnpo2Q99LG2 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tnpo2Q99LG2 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tnpo2Q99LG2 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tnpo2Q99LG2 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tnpo2Q99LG2 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tnpo2Q99LG2 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tnpo2Q99LG2 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tnpo2Q99LG2 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tnpo2Q99LG2 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tnpo2Q99LG2 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tnpo2Q99LG2 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tnpo2Q99LG2 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tnpo2Q99LG2 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tnpo2Q99LG2 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tnpo2Q99LG2 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Tnpo2Q99LG2 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tnpo2Q99LG2 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tnpo2Q99LG2 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tnpo2Q99LG2 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tnpo2Q99LG2 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tnpo2Q99LG2 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tnpo2Q99LG2 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tnpo2Q99LG2 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tnpo2Q99LG2 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tnpo2Q99LG2 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tnpo2Q99LG2 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tnpo2Q99LG2 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tnpo2Q99LG2 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tnpo2Q99LG2 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tnpo2Q99LG2 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tnpo2Q99LG2 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tnpo2Q99LG2 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tnpo2Q99LG2 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tnpo2Q99LG2 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Tnpo2Q99LG2 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tnpo2Q99LG2 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tnpo2Q99LG2 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tnpo2Q99LG2 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tnpo2Q99LG2 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tnpo2Q99LG2 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tnpo2Q99LG2 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms