Protein–RNA interactions for Protein: Q99L02

Pagr1a, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pagr1aQ99L02 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pagr1aQ99L02 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pagr1aQ99L02 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pagr1aQ99L02 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pagr1aQ99L02 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pagr1aQ99L02 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pagr1aQ99L02 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pagr1aQ99L02 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pagr1aQ99L02 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pagr1aQ99L02 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pagr1aQ99L02 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pagr1aQ99L02 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pagr1aQ99L02 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pagr1aQ99L02 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pagr1aQ99L02 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pagr1aQ99L02 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pagr1aQ99L02 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pagr1aQ99L02 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pagr1aQ99L02 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pagr1aQ99L02 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Pagr1aQ99L02 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pagr1aQ99L02 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pagr1aQ99L02 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pagr1aQ99L02 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Pagr1aQ99L02 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Pagr1aQ99L02 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pagr1aQ99L02 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pagr1aQ99L02 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pagr1aQ99L02 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pagr1aQ99L02 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pagr1aQ99L02 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pagr1aQ99L02 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pagr1aQ99L02 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pagr1aQ99L02 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pagr1aQ99L02 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pagr1aQ99L02 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pagr1aQ99L02 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pagr1aQ99L02 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pagr1aQ99L02 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pagr1aQ99L02 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pagr1aQ99L02 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pagr1aQ99L02 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pagr1aQ99L02 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pagr1aQ99L02 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pagr1aQ99L02 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pagr1aQ99L02 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pagr1aQ99L02 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pagr1aQ99L02 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pagr1aQ99L02 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pagr1aQ99L02 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pagr1aQ99L02 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pagr1aQ99L02 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pagr1aQ99L02 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pagr1aQ99L02 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pagr1aQ99L02 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pagr1aQ99L02 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pagr1aQ99L02 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pagr1aQ99L02 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pagr1aQ99L02 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pagr1aQ99L02 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pagr1aQ99L02 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pagr1aQ99L02 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pagr1aQ99L02 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pagr1aQ99L02 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pagr1aQ99L02 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pagr1aQ99L02 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Pagr1aQ99L02 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Pagr1aQ99L02 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pagr1aQ99L02 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pagr1aQ99L02 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pagr1aQ99L02 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pagr1aQ99L02 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pagr1aQ99L02 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pagr1aQ99L02 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pagr1aQ99L02 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pagr1aQ99L02 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pagr1aQ99L02 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Pagr1aQ99L02 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pagr1aQ99L02 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pagr1aQ99L02 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Pagr1aQ99L02 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pagr1aQ99L02 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pagr1aQ99L02 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Pagr1aQ99L02 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pagr1aQ99L02 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pagr1aQ99L02 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pagr1aQ99L02 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pagr1aQ99L02 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pagr1aQ99L02 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pagr1aQ99L02 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pagr1aQ99L02 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Pagr1aQ99L02 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pagr1aQ99L02 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Pagr1aQ99L02 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pagr1aQ99L02 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pagr1aQ99L02 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pagr1aQ99L02 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pagr1aQ99L02 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pagr1aQ99L02 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pagr1aQ99L02 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms