Protein–RNA interactions for Protein: Q99JT6

Tlcd1, Calfacilitin, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlcd1Q99JT6 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tlcd1Q99JT6 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tlcd1Q99JT6 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tlcd1Q99JT6 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tlcd1Q99JT6 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tlcd1Q99JT6 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tlcd1Q99JT6 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tlcd1Q99JT6 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tlcd1Q99JT6 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tlcd1Q99JT6 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tlcd1Q99JT6 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tlcd1Q99JT6 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tlcd1Q99JT6 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tlcd1Q99JT6 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tlcd1Q99JT6 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tlcd1Q99JT6 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tlcd1Q99JT6 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tlcd1Q99JT6 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tlcd1Q99JT6 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Tlcd1Q99JT6 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tlcd1Q99JT6 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tlcd1Q99JT6 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tlcd1Q99JT6 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tlcd1Q99JT6 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tlcd1Q99JT6 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tlcd1Q99JT6 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tlcd1Q99JT6 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tlcd1Q99JT6 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tlcd1Q99JT6 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tlcd1Q99JT6 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tlcd1Q99JT6 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tlcd1Q99JT6 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Tlcd1Q99JT6 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tlcd1Q99JT6 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tlcd1Q99JT6 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tlcd1Q99JT6 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tlcd1Q99JT6 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tlcd1Q99JT6 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tlcd1Q99JT6 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tlcd1Q99JT6 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tlcd1Q99JT6 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tlcd1Q99JT6 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tlcd1Q99JT6 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tlcd1Q99JT6 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tlcd1Q99JT6 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tlcd1Q99JT6 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Tlcd1Q99JT6 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tlcd1Q99JT6 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tlcd1Q99JT6 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tlcd1Q99JT6 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tlcd1Q99JT6 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tlcd1Q99JT6 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tlcd1Q99JT6 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tlcd1Q99JT6 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tlcd1Q99JT6 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Tlcd1Q99JT6 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tlcd1Q99JT6 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tlcd1Q99JT6 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tlcd1Q99JT6 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tlcd1Q99JT6 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tlcd1Q99JT6 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tlcd1Q99JT6 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tlcd1Q99JT6 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tlcd1Q99JT6 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tlcd1Q99JT6 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tlcd1Q99JT6 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tlcd1Q99JT6 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tlcd1Q99JT6 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tlcd1Q99JT6 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tlcd1Q99JT6 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tlcd1Q99JT6 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tlcd1Q99JT6 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tlcd1Q99JT6 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tlcd1Q99JT6 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tlcd1Q99JT6 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tlcd1Q99JT6 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tlcd1Q99JT6 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tlcd1Q99JT6 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tlcd1Q99JT6 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tlcd1Q99JT6 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tlcd1Q99JT6 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tlcd1Q99JT6 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tlcd1Q99JT6 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tlcd1Q99JT6 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tlcd1Q99JT6 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tlcd1Q99JT6 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tlcd1Q99JT6 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tlcd1Q99JT6 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tlcd1Q99JT6 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tlcd1Q99JT6 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tlcd1Q99JT6 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tlcd1Q99JT6 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tlcd1Q99JT6 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tlcd1Q99JT6 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tlcd1Q99JT6 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tlcd1Q99JT6 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tlcd1Q99JT6 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tlcd1Q99JT6 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tlcd1Q99JT6 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tlcd1Q99JT6 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms