Protein–RNA interactions for Protein: Q99J19

Smim11a, Small integral membrane protein 11A, mousemouse

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Length 55 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim11aQ99J19 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smim11aQ99J19 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Smim11aQ99J19 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smim11aQ99J19 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smim11aQ99J19 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smim11aQ99J19 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smim11aQ99J19 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smim11aQ99J19 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smim11aQ99J19 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smim11aQ99J19 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smim11aQ99J19 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smim11aQ99J19 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smim11aQ99J19 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smim11aQ99J19 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smim11aQ99J19 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smim11aQ99J19 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smim11aQ99J19 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smim11aQ99J19 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smim11aQ99J19 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smim11aQ99J19 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smim11aQ99J19 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smim11aQ99J19 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smim11aQ99J19 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smim11aQ99J19 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smim11aQ99J19 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Smim11aQ99J19 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smim11aQ99J19 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smim11aQ99J19 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smim11aQ99J19 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smim11aQ99J19 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smim11aQ99J19 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smim11aQ99J19 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smim11aQ99J19 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smim11aQ99J19 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smim11aQ99J19 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smim11aQ99J19 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smim11aQ99J19 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Smim11aQ99J19 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Smim11aQ99J19 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Smim11aQ99J19 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Smim11aQ99J19 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Smim11aQ99J19 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Smim11aQ99J19 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Smim11aQ99J19 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smim11aQ99J19 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smim11aQ99J19 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smim11aQ99J19 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smim11aQ99J19 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smim11aQ99J19 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smim11aQ99J19 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smim11aQ99J19 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smim11aQ99J19 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smim11aQ99J19 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smim11aQ99J19 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smim11aQ99J19 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smim11aQ99J19 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smim11aQ99J19 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smim11aQ99J19 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smim11aQ99J19 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smim11aQ99J19 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smim11aQ99J19 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smim11aQ99J19 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smim11aQ99J19 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smim11aQ99J19 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smim11aQ99J19 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smim11aQ99J19 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smim11aQ99J19 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smim11aQ99J19 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smim11aQ99J19 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smim11aQ99J19 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smim11aQ99J19 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smim11aQ99J19 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Smim11aQ99J19 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smim11aQ99J19 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Smim11aQ99J19 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smim11aQ99J19 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smim11aQ99J19 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smim11aQ99J19 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Smim11aQ99J19 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smim11aQ99J19 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smim11aQ99J19 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smim11aQ99J19 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smim11aQ99J19 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smim11aQ99J19 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smim11aQ99J19 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smim11aQ99J19 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smim11aQ99J19 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smim11aQ99J19 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smim11aQ99J19 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smim11aQ99J19 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smim11aQ99J19 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smim11aQ99J19 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smim11aQ99J19 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smim11aQ99J19 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smim11aQ99J19 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smim11aQ99J19 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smim11aQ99J19 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smim11aQ99J19 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smim11aQ99J19 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smim11aQ99J19 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
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