Protein–RNA interactions for Protein: Q925F3

Rnf144a, E3 ubiquitin-protein ligase RNF144A, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf144aQ925F3 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnf144aQ925F3 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnf144aQ925F3 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnf144aQ925F3 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnf144aQ925F3 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnf144aQ925F3 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnf144aQ925F3 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnf144aQ925F3 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnf144aQ925F3 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnf144aQ925F3 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnf144aQ925F3 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnf144aQ925F3 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnf144aQ925F3 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnf144aQ925F3 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnf144aQ925F3 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnf144aQ925F3 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnf144aQ925F3 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnf144aQ925F3 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnf144aQ925F3 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnf144aQ925F3 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnf144aQ925F3 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnf144aQ925F3 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnf144aQ925F3 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnf144aQ925F3 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnf144aQ925F3 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnf144aQ925F3 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnf144aQ925F3 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnf144aQ925F3 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnf144aQ925F3 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnf144aQ925F3 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnf144aQ925F3 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnf144aQ925F3 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnf144aQ925F3 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnf144aQ925F3 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnf144aQ925F3 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnf144aQ925F3 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnf144aQ925F3 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnf144aQ925F3 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnf144aQ925F3 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnf144aQ925F3 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnf144aQ925F3 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnf144aQ925F3 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnf144aQ925F3 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnf144aQ925F3 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnf144aQ925F3 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnf144aQ925F3 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnf144aQ925F3 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnf144aQ925F3 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnf144aQ925F3 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnf144aQ925F3 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnf144aQ925F3 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnf144aQ925F3 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnf144aQ925F3 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnf144aQ925F3 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnf144aQ925F3 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnf144aQ925F3 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnf144aQ925F3 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnf144aQ925F3 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnf144aQ925F3 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnf144aQ925F3 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnf144aQ925F3 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnf144aQ925F3 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnf144aQ925F3 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnf144aQ925F3 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnf144aQ925F3 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnf144aQ925F3 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnf144aQ925F3 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnf144aQ925F3 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnf144aQ925F3 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnf144aQ925F3 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnf144aQ925F3 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnf144aQ925F3 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnf144aQ925F3 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnf144aQ925F3 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnf144aQ925F3 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnf144aQ925F3 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnf144aQ925F3 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rnf144aQ925F3 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rnf144aQ925F3 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rnf144aQ925F3 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rnf144aQ925F3 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rnf144aQ925F3 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rnf144aQ925F3 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rnf144aQ925F3 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rnf144aQ925F3 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rnf144aQ925F3 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rnf144aQ925F3 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rnf144aQ925F3 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rnf144aQ925F3 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Rnf144aQ925F3 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rnf144aQ925F3 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rnf144aQ925F3 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rnf144aQ925F3 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rnf144aQ925F3 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rnf144aQ925F3 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rnf144aQ925F3 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rnf144aQ925F3 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rnf144aQ925F3 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rnf144aQ925F3 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rnf144aQ925F3 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms