Protein–RNA interactions for Protein: Q924N9

Prss28, Serine protease 28, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prss28Q924N9 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prss28Q924N9 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prss28Q924N9 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prss28Q924N9 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prss28Q924N9 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prss28Q924N9 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prss28Q924N9 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prss28Q924N9 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prss28Q924N9 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prss28Q924N9 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prss28Q924N9 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Prss28Q924N9 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prss28Q924N9 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prss28Q924N9 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prss28Q924N9 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prss28Q924N9 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prss28Q924N9 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prss28Q924N9 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prss28Q924N9 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prss28Q924N9 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prss28Q924N9 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prss28Q924N9 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prss28Q924N9 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prss28Q924N9 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prss28Q924N9 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prss28Q924N9 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prss28Q924N9 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prss28Q924N9 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prss28Q924N9 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Prss28Q924N9 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prss28Q924N9 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Prss28Q924N9 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prss28Q924N9 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prss28Q924N9 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prss28Q924N9 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Prss28Q924N9 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prss28Q924N9 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Prss28Q924N9 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prss28Q924N9 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prss28Q924N9 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prss28Q924N9 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prss28Q924N9 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prss28Q924N9 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prss28Q924N9 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prss28Q924N9 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prss28Q924N9 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prss28Q924N9 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prss28Q924N9 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prss28Q924N9 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Prss28Q924N9 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prss28Q924N9 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Prss28Q924N9 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prss28Q924N9 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prss28Q924N9 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prss28Q924N9 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prss28Q924N9 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prss28Q924N9 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prss28Q924N9 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prss28Q924N9 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prss28Q924N9 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prss28Q924N9 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prss28Q924N9 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prss28Q924N9 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prss28Q924N9 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Prss28Q924N9 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Prss28Q924N9 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prss28Q924N9 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prss28Q924N9 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prss28Q924N9 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prss28Q924N9 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prss28Q924N9 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prss28Q924N9 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prss28Q924N9 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prss28Q924N9 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prss28Q924N9 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prss28Q924N9 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prss28Q924N9 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prss28Q924N9 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prss28Q924N9 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prss28Q924N9 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prss28Q924N9 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prss28Q924N9 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prss28Q924N9 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prss28Q924N9 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prss28Q924N9 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prss28Q924N9 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prss28Q924N9 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prss28Q924N9 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Prss28Q924N9 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prss28Q924N9 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prss28Q924N9 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prss28Q924N9 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prss28Q924N9 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prss28Q924N9 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prss28Q924N9 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prss28Q924N9 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prss28Q924N9 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prss28Q924N9 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prss28Q924N9 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prss28Q924N9 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms