Protein–RNA interactions for Protein: Q920N1

Odf3, Outer dense fiber protein 3, mousemouse

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Length 254 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf3Q920N1 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Odf3Q920N1 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Odf3Q920N1 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Odf3Q920N1 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Odf3Q920N1 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Odf3Q920N1 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Odf3Q920N1 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Odf3Q920N1 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Odf3Q920N1 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Odf3Q920N1 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Odf3Q920N1 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Odf3Q920N1 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Odf3Q920N1 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Odf3Q920N1 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Odf3Q920N1 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Odf3Q920N1 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Odf3Q920N1 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Odf3Q920N1 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Odf3Q920N1 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Odf3Q920N1 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Odf3Q920N1 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Odf3Q920N1 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Odf3Q920N1 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Odf3Q920N1 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Odf3Q920N1 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Odf3Q920N1 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Odf3Q920N1 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Odf3Q920N1 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Odf3Q920N1 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Odf3Q920N1 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Odf3Q920N1 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Odf3Q920N1 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Odf3Q920N1 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Odf3Q920N1 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Odf3Q920N1 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Odf3Q920N1 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Odf3Q920N1 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Odf3Q920N1 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Odf3Q920N1 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Odf3Q920N1 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Odf3Q920N1 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Odf3Q920N1 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Odf3Q920N1 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Odf3Q920N1 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Odf3Q920N1 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Odf3Q920N1 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Odf3Q920N1 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Odf3Q920N1 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Odf3Q920N1 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Odf3Q920N1 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Odf3Q920N1 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Odf3Q920N1 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Odf3Q920N1 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Odf3Q920N1 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Odf3Q920N1 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Odf3Q920N1 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Odf3Q920N1 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Odf3Q920N1 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Odf3Q920N1 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Odf3Q920N1 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Odf3Q920N1 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Odf3Q920N1 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Odf3Q920N1 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Odf3Q920N1 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Odf3Q920N1 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Odf3Q920N1 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Odf3Q920N1 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Odf3Q920N1 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Odf3Q920N1 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Odf3Q920N1 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Odf3Q920N1 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Odf3Q920N1 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Odf3Q920N1 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Odf3Q920N1 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Odf3Q920N1 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Odf3Q920N1 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Odf3Q920N1 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Odf3Q920N1 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Odf3Q920N1 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Odf3Q920N1 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Odf3Q920N1 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Odf3Q920N1 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Odf3Q920N1 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Odf3Q920N1 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Odf3Q920N1 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Odf3Q920N1 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Odf3Q920N1 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Odf3Q920N1 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Odf3Q920N1 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Odf3Q920N1 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Odf3Q920N1 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Odf3Q920N1 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Odf3Q920N1 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Odf3Q920N1 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Odf3Q920N1 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Odf3Q920N1 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Odf3Q920N1 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Odf3Q920N1 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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