Protein–RNA interactions for Protein: Q91WC0

Setd3, Histone-lysine N-methyltransferase setd3, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd3Q91WC0 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Setd3Q91WC0 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Setd3Q91WC0 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Setd3Q91WC0 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Setd3Q91WC0 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Setd3Q91WC0 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Setd3Q91WC0 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Setd3Q91WC0 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Setd3Q91WC0 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Setd3Q91WC0 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Setd3Q91WC0 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Setd3Q91WC0 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Setd3Q91WC0 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Setd3Q91WC0 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Setd3Q91WC0 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Setd3Q91WC0 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Setd3Q91WC0 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Setd3Q91WC0 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Setd3Q91WC0 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Setd3Q91WC0 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Setd3Q91WC0 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Setd3Q91WC0 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Setd3Q91WC0 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Setd3Q91WC0 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Setd3Q91WC0 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Setd3Q91WC0 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Setd3Q91WC0 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Setd3Q91WC0 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Setd3Q91WC0 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Setd3Q91WC0 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Setd3Q91WC0 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Setd3Q91WC0 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Setd3Q91WC0 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Setd3Q91WC0 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Setd3Q91WC0 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Setd3Q91WC0 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Setd3Q91WC0 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Setd3Q91WC0 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Setd3Q91WC0 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Setd3Q91WC0 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Setd3Q91WC0 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Setd3Q91WC0 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Setd3Q91WC0 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Setd3Q91WC0 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Setd3Q91WC0 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Setd3Q91WC0 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Setd3Q91WC0 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Setd3Q91WC0 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Setd3Q91WC0 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Setd3Q91WC0 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Setd3Q91WC0 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Setd3Q91WC0 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Setd3Q91WC0 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Setd3Q91WC0 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Setd3Q91WC0 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Setd3Q91WC0 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Setd3Q91WC0 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Setd3Q91WC0 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Setd3Q91WC0 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Setd3Q91WC0 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Setd3Q91WC0 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Setd3Q91WC0 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Setd3Q91WC0 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Setd3Q91WC0 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Setd3Q91WC0 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Setd3Q91WC0 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Setd3Q91WC0 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Setd3Q91WC0 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Setd3Q91WC0 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Setd3Q91WC0 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Setd3Q91WC0 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Setd3Q91WC0 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Setd3Q91WC0 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Setd3Q91WC0 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Setd3Q91WC0 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Setd3Q91WC0 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Setd3Q91WC0 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Setd3Q91WC0 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Setd3Q91WC0 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Setd3Q91WC0 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Setd3Q91WC0 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Setd3Q91WC0 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Setd3Q91WC0 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Setd3Q91WC0 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Setd3Q91WC0 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Setd3Q91WC0 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Setd3Q91WC0 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Setd3Q91WC0 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Setd3Q91WC0 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Setd3Q91WC0 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Setd3Q91WC0 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Setd3Q91WC0 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Setd3Q91WC0 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Setd3Q91WC0 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Setd3Q91WC0 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Setd3Q91WC0 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Setd3Q91WC0 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Setd3Q91WC0 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Setd3Q91WC0 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Setd3Q91WC0 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms