Protein–RNA interactions for Protein: Q91W92

Cdc42ep1, Cdc42 effector protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc42ep1Q91W92 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdc42ep1Q91W92 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdc42ep1Q91W92 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdc42ep1Q91W92 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdc42ep1Q91W92 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdc42ep1Q91W92 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdc42ep1Q91W92 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdc42ep1Q91W92 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdc42ep1Q91W92 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdc42ep1Q91W92 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdc42ep1Q91W92 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdc42ep1Q91W92 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdc42ep1Q91W92 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdc42ep1Q91W92 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdc42ep1Q91W92 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdc42ep1Q91W92 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdc42ep1Q91W92 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdc42ep1Q91W92 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdc42ep1Q91W92 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdc42ep1Q91W92 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdc42ep1Q91W92 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdc42ep1Q91W92 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdc42ep1Q91W92 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdc42ep1Q91W92 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdc42ep1Q91W92 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdc42ep1Q91W92 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdc42ep1Q91W92 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdc42ep1Q91W92 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdc42ep1Q91W92 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdc42ep1Q91W92 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdc42ep1Q91W92 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdc42ep1Q91W92 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdc42ep1Q91W92 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdc42ep1Q91W92 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdc42ep1Q91W92 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdc42ep1Q91W92 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdc42ep1Q91W92 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdc42ep1Q91W92 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdc42ep1Q91W92 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdc42ep1Q91W92 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdc42ep1Q91W92 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdc42ep1Q91W92 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdc42ep1Q91W92 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdc42ep1Q91W92 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdc42ep1Q91W92 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdc42ep1Q91W92 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdc42ep1Q91W92 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdc42ep1Q91W92 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cdc42ep1Q91W92 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cdc42ep1Q91W92 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cdc42ep1Q91W92 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cdc42ep1Q91W92 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdc42ep1Q91W92 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdc42ep1Q91W92 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdc42ep1Q91W92 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdc42ep1Q91W92 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdc42ep1Q91W92 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdc42ep1Q91W92 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdc42ep1Q91W92 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdc42ep1Q91W92 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdc42ep1Q91W92 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdc42ep1Q91W92 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdc42ep1Q91W92 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdc42ep1Q91W92 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdc42ep1Q91W92 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdc42ep1Q91W92 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdc42ep1Q91W92 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdc42ep1Q91W92 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdc42ep1Q91W92 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdc42ep1Q91W92 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdc42ep1Q91W92 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdc42ep1Q91W92 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdc42ep1Q91W92 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdc42ep1Q91W92 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdc42ep1Q91W92 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdc42ep1Q91W92 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdc42ep1Q91W92 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdc42ep1Q91W92 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdc42ep1Q91W92 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdc42ep1Q91W92 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdc42ep1Q91W92 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdc42ep1Q91W92 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdc42ep1Q91W92 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdc42ep1Q91W92 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdc42ep1Q91W92 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdc42ep1Q91W92 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdc42ep1Q91W92 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdc42ep1Q91W92 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdc42ep1Q91W92 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdc42ep1Q91W92 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdc42ep1Q91W92 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdc42ep1Q91W92 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdc42ep1Q91W92 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdc42ep1Q91W92 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdc42ep1Q91W92 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdc42ep1Q91W92 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdc42ep1Q91W92 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdc42ep1Q91W92 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdc42ep1Q91W92 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdc42ep1Q91W92 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms