Protein–RNA interactions for Protein: Q91VE6

Nifk, MKI67 FHA domain-interacting nucleolar phosphoprotein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NifkQ91VE6 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NifkQ91VE6 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NifkQ91VE6 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NifkQ91VE6 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NifkQ91VE6 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NifkQ91VE6 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NifkQ91VE6 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NifkQ91VE6 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NifkQ91VE6 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NifkQ91VE6 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NifkQ91VE6 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NifkQ91VE6 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NifkQ91VE6 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NifkQ91VE6 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NifkQ91VE6 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NifkQ91VE6 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NifkQ91VE6 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NifkQ91VE6 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NifkQ91VE6 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NifkQ91VE6 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NifkQ91VE6 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NifkQ91VE6 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NifkQ91VE6 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NifkQ91VE6 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NifkQ91VE6 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NifkQ91VE6 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NifkQ91VE6 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NifkQ91VE6 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
NifkQ91VE6 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NifkQ91VE6 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NifkQ91VE6 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NifkQ91VE6 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NifkQ91VE6 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NifkQ91VE6 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NifkQ91VE6 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NifkQ91VE6 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NifkQ91VE6 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NifkQ91VE6 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NifkQ91VE6 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NifkQ91VE6 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NifkQ91VE6 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NifkQ91VE6 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NifkQ91VE6 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NifkQ91VE6 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NifkQ91VE6 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NifkQ91VE6 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NifkQ91VE6 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NifkQ91VE6 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NifkQ91VE6 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NifkQ91VE6 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NifkQ91VE6 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NifkQ91VE6 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NifkQ91VE6 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NifkQ91VE6 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NifkQ91VE6 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NifkQ91VE6 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NifkQ91VE6 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NifkQ91VE6 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NifkQ91VE6 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NifkQ91VE6 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NifkQ91VE6 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NifkQ91VE6 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
NifkQ91VE6 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NifkQ91VE6 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NifkQ91VE6 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
NifkQ91VE6 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NifkQ91VE6 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NifkQ91VE6 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NifkQ91VE6 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NifkQ91VE6 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NifkQ91VE6 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
NifkQ91VE6 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NifkQ91VE6 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NifkQ91VE6 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NifkQ91VE6 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NifkQ91VE6 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NifkQ91VE6 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NifkQ91VE6 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NifkQ91VE6 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NifkQ91VE6 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NifkQ91VE6 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NifkQ91VE6 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NifkQ91VE6 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NifkQ91VE6 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NifkQ91VE6 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NifkQ91VE6 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NifkQ91VE6 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NifkQ91VE6 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NifkQ91VE6 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NifkQ91VE6 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NifkQ91VE6 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NifkQ91VE6 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NifkQ91VE6 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NifkQ91VE6 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NifkQ91VE6 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NifkQ91VE6 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NifkQ91VE6 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NifkQ91VE6 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NifkQ91VE6 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NifkQ91VE6 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms